لطفا برای مشاهده چکیده به متن کامل (PDF) مراجعه فرمایید.

کوروناویروس سندروم تنفسی خاورمیانه (MERS-CoV) به عنوان عامل ایجاد عفونت شدید دستگاه تنفسی تحتانی در انسان، یک تهدید جهانی مخصوصا در کشورهای حاشیه خلیج فارس محسوب می شود. از زمان کشف این ویروس در سال 2012، بیش از 1800 نفر در 27 کشور جهان تحت تاثیر عفونت ناشی از این ویروس قرارگرفته اند که از این تعداد، بیش از 600 مورد مرگ گزارش شده است. نرخ مرگ ومیر ویروس MERS (مرس) در مقایسه با ویروس SARS (سارس)، بیشتر است (40 درصد در مقابل 10 درصد) و این نرخ به خصوص در افراد مبتلا به بیماری های زمینه ای بالاتر است. اکثر موارد مرس (بیش از 85 درصد) که تاکنون گزارش شده است، سابقه اقامت یا مسافرت به کشورهای خاورمیانه را داشته اند. به احتمال زیاد، شتر به عنوان یک میزبان حد واسط برای این ویروس محسوب می شود. خصوصیات بالینی عفونت مرس متفاوت بوده و طیفی از عفونت بدون علامت یا ملایم تا سندروم تنفسی حاد و نارسایی در چندین ارگان را در بر می گیرد و به خصوص در افراد مبتلا به بیماری های زمینه ای می تواند به مرگ منتهی شود. داروی خاصی جهت درمان عفونت مرس وجود ندارد و جهت جلوگیری از انتشار این ویروس در مراکز مراقبتی بهداشتی، نیاز به اقدامات پیشگیرانه و کنترلی است. در مطالعه حاضر، به طور مختصر به بررسی آخرین اطلاعات در مورد اپیدمیولوژی، خصوصیات بالینی، تشخیص، درمان و پیشگیری از این عفونت می پردازیم.

در 31 ماه دسامبر 2019 میلادی، مواردی از عفونت شدید تنفسی در شهر ووهان کشور چین گزارش شد. گزارش های مرکز کنترل و پیشگیری بیماری (CDC) حاکی از آن است که عامل اپیدمی تنفسی اخیر، کرونا ویروس جدید 2019 (2019-nCoV) می باشد. احتمال داده می شود که این بیماری به واسطه غذاهای دریایی و حیوانات شیوع پیدا کرده باشد و همچنین احتمال انتقال بیماری به صورت انسان به انسان در بین مبتلایان وجود دارد. 1 از آن جایی که خفاش منبع طبیعی انواع مختلفی از ویروس ها از جمله کرونا ویروس می باشد، این احتمال وجود دارد که خفاش مخزن اصلی ویروس جدید باشد. 2 موتاسیون در کرونا ویروس ها بسیار رایج است و این تغییرات بیشتر به دلیل نوترکیبی ها در ژنوم ویروس در مرحله تکثیر ویروس و طی تکثیر RNA ساب ژنومیک حاصل می شوند. این نوترکیبی های همولوگوس در کوروناویروس ها به واسطه پدیده Copy-choice اتفاق می افتند. 3 اگرچه این ویروس کشنده بوده اما نسبت به سایر ویروس های کشنده هم خانواده خود نظیر سارس از قدرت کشندگی کمتری برخوردار است. . . .

بیماری سارس با سندرم تنفسی حاد با بروز ناگهانی یک نوع ذات الریه آتی پیک با عامل ویروسی از خانوده کرونا ویروس ها می باشد که از یکی از ایالات جنوبی چین آغاز شده و با شیوع در منطقه شرق آسیا به بیش از 30 کشور جهان منتقل شده است. در چند ماهه گذشته سبب ابتلا 5000 نفر و بیش از 300 مرگ گردیده است. ویروس از تماس نزدیک با افراد آلوده و همچنین مدفوع فرد آلوده منتقل می شود. دوره کمون بیماری بین 7-2 روز و گاه تا 10 روز می باشد. بیماری با علایم شبه سرماخوردگی، تب 38 درجه، درد عضلات و سرفه خشک آغاز شده و توسعه می یابد. عکس ریه در تعدادی از بیماران علایم پنومونی یک طرفه و یا دو طرفه را نشان می دهد. علایم آزمایشگاهی می تواند شامل لنفوپنی، کاهش اکسیژن خون و افزایش CPK و LDH باشد. با شناسایی ژنوم ویروس عامل بیماری که نوع جدید از خانواده کرونا ویروس ها است. روش های نوین ملکولی تشخیص ویروس در نمونه های کلینیکی با استفاده از RT-PCR در عرض چند ساعت امکان پذیر شده است. به نظر می رسد منشا این ویروس حیوانات اهلی به خصوص پرندگان باشند. با توجه به سیر متفاوت بیماری در 10% افراد که دچار مشکلات تنفسی می باشند، استفاده از دستگاه تنفس مصنوعی لازم است. درمان با استفاده از استروئید و آنتی بیوتیک های وسیع الطیف و داروهای ضد ویروسی مانند ریباویرین در موارد حاد توصیه می شود. جهت پیشگیری از ابتلا و شیوع بیماری عدم مسافرت به مناطق پرخطر توصیه شده است. در صورت تماس با فرد آلوده کنترل مرتب دمای بدن به مدت 10 روز و در صورت بروز تب 38 درجه و وجود علایم مراجه سریع به مراکز بهداشتی توصیه می گردد. با توجه به آمار بالای آلودگی کادر بهداشت و درمان که با تماس با بیماران بوده اند، آگاهی و توجه جدی پزشکان و کادر بهداشتی درمانی به نکات مراقبتی و پیشگیری ضرورت دارد.

در این بررسی از کیت تجارتی الایزای رقابتی جهت اندازه گیری پادتن های ضد E. coli K99، روتاویروس و کورناویروس در 240 نمونه آغوز اخذ شده از گاوان هلشتاین نژاد شیری در یک واحد گاوداری جنوب تهران استفاده گردید.ملاک مثبت شدن در الایزای رقابتی به این ترتیب بود که نمونه های با درصد جلوگیری 20<(1+)، 40<(2+)، 60<(3+)، 80<(4+) مثبت به حساب آمد لکن فقط نمونه هایی که درصد جلوگیری بزرگتر از 80 داشتند آغوز با تیتر بالای آنتی بادی در نظر گرفته شدند. داده ها نشان داد که پادتن ضد E. coli در 76%، ضد کوروناویروس در 99% و ضد روتاویروس در 100% نمونه ها وجود دارد. لکن از 240 نمونه آغوز فقط 14 مورد (5.83%) پادتن باتیتر بالای ضد E. coli، 222 مورد (92.5%) پادتن ضد کورونا و 240 مورد (100%) پادتن ضد روتاویروس که 80< درصد جلوگیری (4+) در الایزا داشتند، بدست آمد که به عنوان آغوز با تیتر بالا در نظر گرفته شدند. نتایج این مطالعه نشان داد که در مورد آنتی بادی های ضد E. coli تعداد کمی از نمونه ها (5.83%) دارای پادتن با تیتر بالا بودند و حال آنکه در مورد کوروناویروس و روتاویروس به ترتیب 92.5% و 100% از نمونه ها دارای پادتن با تیتر بالا بودند: از اینرو نتیجه گرفته می شود که از آغوز مخلوط گاوان غیر واکسینه بر ضد روتا و کوروناویروس می توان به منظور ایجاد ایمنی غیر فعال (Passive) در گوساله های نوزاد جهت جلوگیری از اسهال گوساله ها استفاده نمود.

سندرم حاد تنفسی ( Sever Acute Respiratory Syndrome) وضعیتی است با علت ناشناخته که اخیرا در کشورهای آسیایی ( چین، اندونزی، سنگاپور و ویتنام) شیوع یافته و همچنین در کشورهای مختلف آمریکای شمالی و اروپا گزارش شده است بیماری تا کنون میلیاردها دلار خسارت وارد نموده و صدها نفر به کام مرگ کشیده شده اند. در این مقاله یافته های اولیه اپیدمیولوژیک، کلینیکی و آزمایشگاهی 20 بیمار مبتلا به سارس در هنگ کنگ و کانادا بررسی شده است (10 بیمار از کانادا و 10 نفر از هنگ کنگ) و نمونه های خون، خلط و ادرار تمام بیماران به آزمایشگاههای بین المللی منطقه ای و ایالتی جهت مطالعه فرستاده شده است. محدوده سنی بیماران کانادایی بین 78-24 سال و 60 % آنها مرد بودن و محدوده سنی بیماران هنگ کنگی 72-38 سال بود (5 نفر مرد و 5 نفر زن). شایعترین علامت بالینی آنها تب و احساس کوفتگی بوده که با سرفه خشک و تنگی نفس ادامه یافته است در رادیوگرافی همه بیماران درگیری ریوی مشاهده شده است. لنفوپنی، افزایش لاکتات دهید روژناز، آمینو ترانسفراز کبدی و کراتین کیناز دیده شده است. درمانهای تجربی شامل آنتی بیوتیک، ریباویرین، کورتیکو استروئید و Oseltamivir بود. 10 بیمار از 20 بیمار نیاز به تهویه مکانیکی پیدا کردند و 5 بیمار فوت کرد. تمام بررسیهای میکروبیولوژیک منفی بود. در آزمایشات ویرولوژیک به طریقه (RT-PCR) Reverse Transcriptase متاپنوموویروس و Novel Cornavirus از 10 بیمار به دست آمد. سارس حالتی است که همراه با موربیدیتی و مورتابیتی بالایی است. منشا آن ویروسی بوده که از طریق قطرات تنفسی بیماران و تماس منتقل می شود. در مورد این که آیا متاپنوموویروس به تنهایی یا Novel Coronavirus یا هر دو آنها در ایجاد بیماری سارس نقش دارند یا نه احتیاج به تحقیقات و بررسی های بیشتر داریم.

در این تحقیق از 184 گوساله زیر یک ماهه شامل 84 گوساله مبتلا به اسهال و 100 گوساله سالم نمونه خون اخذ گردید و روی آنها آزمایش های سرم شناسی شامل الایزای مستقیم برای تشخیص آنتی بادی های ضد آنتی ژن K99 اشریشیاکلی، روتاویروس و کوروناویروس و نیز آزمایش آگلوتیناسیون لوله ای برای تشخیص آنتی بادی های ضد آنتی ژن O157 اشریشیاکلی انجام شد. نتایج نشان داد که آنتی بادی های ضد اشریشیاکلی K99 در سرم 56 درصد گوساله های اسهالی و 66 درصد گوساله های سالم و آنتی بادی های ضد اشریشیاکلی O157 در سرم 82 درصد گوساله های اسهالی و 69 درصد گوساله های سالم وجود دارد. آنتی بادی های ضد روتاویروس در همه نمونه های سرمی گوساله های اسهالی و 99 درصد نمونه های سرمی گوساله های سالم تشخیص داده شد. همچنین آنتی بادی های ضد کوروناویروس در سرم 82 درصد گوساله های اسهالی و 72 درصد گوساله های سالم شناسایی شد. تشخیص آنتی بادی های ضد اشریشیاکلی (K99 و O157) و روتاویروس و کوروناویروس در سرم گوساله، مواجهه جمعیت مورد مطالعه را با این سویه ها نشان می دهد. حضور قابل توجه این آنتی بادی ها در هر دو جمعیت گوساله های سالم و مبتلا به اسهال عدم ارتباط بین سطح سرمی این آنتی بادی ها و حفاظت گوساله در برابر اسهال را می تواند خاطر نشان نماید.   

در نوامبر 2002، یک تاجر چینی در ایالت جنوبی چین «گوانگ دانگ» اولین قربانی بیماری اسرار آمیزی شد که آن را بعدا سندرم حاد تنفسی شدید «سارس» نامیدند. ایالت گوانگ دانگ یک منطقه زراعی با جمعیتی حدود 75 میلیون می باشد و دارای هزاران مزرعه بادام های کوچک و بزرگ، آب و هوای گرمسیری و بارندگی حدود 2 متر در سال می باشد.به اولین بیماری سارس و سایر بیماران اولیه، هیچ نوع توجه جهانی نشد تا ماه فوریه 2003 که یک پزشک چینی اهل گوانگ دانگ بیمار شد. پزشک مزبور در طبقه نهم یک هتل در هنگ کنگ اقامت داشت. 12 مهمان هتل که هفت نفر از آنها نیز در طبقه نهم همان هتل زندگی می کردند دچار بیماری شدند و این بیماران مقیم هتل، موارد اولیه بیماری سارس بودند که بیماری را به ویتنام، سنگاپور، کانادا، ایرلند و ایالات متحده انتقال دادند. تاکنون )ژوئن2003 ( نزدیک 9 هزار نفر در حدود 30 کشور دنیا به این بیماری آلوده شدند که %4.9 این بیماران با تابلو سندرم حاد تنفسی حاد فوت نمودند.عامل این بیماری در ابتدا روشن نبود ولی امروز عامل آن را یک کوروناویروس نوظهور می دانند و این ویروس را در vero-cell-culture جدا نموده اند. در این بیماران آنتی بادی با تیتر بالا علیه این ویروس پیدا می شود و با gene sequencing تنها یک گونه از خانواده کوروناویروس ها عامل اصلی سندرم حاد تنفسی شدید شناخته شده است.

سردبیر محترم توالی یابی نسل جدید (NGS) یک فناوری توالی یابی موازی انبوه است که توان عملیاتی، مقیاس پذیری و سرعت فوق العاده بالایی را ارایه می دهد. این فناوری برای تعیین ترتیب نوکلیوتیدها در کل ژنوم یا مناطق هدف DNA یا RNA استفاده می شود. NGS علوم زیستی را متحول کرده است و به آزمایشگاه ها اجازه می دهد تا کارهای متنوعی را انجام دهند و سیستم های بیولوژیکی را در سطحی که قبلا ممکن نبوده مطالعه کنند. تکنولوژی توالی یابی نسل جدید در بسیاری از آزمایشگاه ها در سرتاسر جهان برای بررسی های ساختمان ژنتیکی به کار می رود اما تاکنون این تکنولوژی در تشخیص بیماری های عفونی به ندرت مورد استفاده قرارگرفته است. اکثر روش های توالی یابی نسل جدید مبتنی بر فرآیند خاتمه زنجیره هستند. بدین ترتیب که با اضافه کردن دی دیوکسی نوکلیوتید لیبل شده با فلویورسانت واکنش PCR خاتمه می یابد و خوانش توالی صورت می گیرد (1). این تکنولوژی امکان نقشه برداری کل ژنوم را با هزینه مقرون به صرفه ارایه می دهد. در حال حاضر پاندمی کووید 19 و ویروس سارس کروناویروس 2 عامل این بیماری که دارای تغییرات ژنومی زیاد است و باعث رخداد های غیر معمول در بالین می شود بیش از پیش توجه دانشمندان را به سمت سطوح بالاتری از بررسی های ژنتیکی جلب نموده است (2، 3). تکنیک توالی یابی نسل جدید در به دست آوردن اطلاعات ضروری در مورد یک پاتوژن در ابتدای شیوع عفونی مفید است و می تواند به عنوان یک روش تشخیصی برای عفونت کووید 19 استفاده شود (4) و همچنین می تواند در شناسایی دقیق عفونت همزمان در بیماران کووید 19 مفید واقع شود. اپیدمیولوژی ژنومی سارس کوروناویروس 2 منجر به شناسایی چندین جهش از سویه اصلی ووهان-سارس کوروناویروس 2 شده است. در طول بهار سال 2020، یک جهش غیر مترادف که منجر به جایگزینی پروتیین D614G در اسپایک ویروس می شود در توالی های گزارش شده غالب شد و در نتیجه میل ترکیبی بالاتر برای گیرنده ACE2، تکثیر ویروسی را تقویت کرد...

بیماری کورونا ویروس گربه، یک موضوع بحث برانگیز و یکی از بیماری های مهم عفونی است که منجر به مرگ گربه ها می شود. بسیاری از سویه های تهاجمی و پرحدت کوروناویروس گربه، سندروم بالینی بیماری را ایجاد می کنند که پریتونیت عفونی گربه (Feline infectious peritonitis) نامیده می شود. برای تعیین حساسیت و ویژگی آزمون الایزا از 25 قلاده گربه مشکوک به پریتونیت عفونی گربه (16 قلاده مربوط به نوع ترشحی و 9 قلاده مربوط به نوع خشک) که از سال 1392 تا 1394 از 8 درمانگاه واقع در شمال غرب تهران جمع آوری شده بود، استفاده شد. در ضمن 7 قلاده گربه به عنوان گروه کنترل در نظر گرفته شد. آزمون الایزا روی سرم و مایع شکمی انجام و هیستوپاتولوژی به عنوان استاندارد طلایی در تشخیص بیماری پریتونیت عفونی گربه در نظر گرفته شد. تجزیه و تحلیل آماری با استفاده از نمودار ROC، شاخص Youden Index، آزمون Mann-Whitney U و نرم افزار R و SPSS انجام شد. حساسیت، ویژگی و ارزش اخباری مثبت و منفی برای آزمون الایزا در 13 قلاده گربه مبتلا به نوع ترشحی و 7 قلاده گربه سالم با توجه به یافته های پاتولوژی %100 برآورد گردید. سطح زیر منحنی (Area under the ROC curve: AUC) برابر 1 شد که نشان دهنده آن است که الایزا از ارزش تشخیصی بالایی برخوردار است (P<0.05). نقطه برش برای نسبت OD در گربه های مثبت به OD کنترل منفی، 3.375 تعیین شد. نظر به اینکه حساسیت و ویژگی کیت مورد نظر برای تشخیص گربه های مبتلا به FIP مناسب می باشد و ارزش تشخیصی بالایی دارد، می تواند در کنار سایر روش های تشخیصی، مورد استفاده قرار گیرد.