اکثر بیماریهای پالپ و پری آپیکال، در نتیجه درگیر شدن مستقیم یا غیرمستقیم این بافتها توسط باکتری های محیط دهان به وجود می آیند و عفونت کانال ریشه، Multibacterial بوده و گونه های مختلفی از باکتری ها در ایجاد آن نقش دارند. لذا اطلاع داشتن راجع به نوع و خصوصیات گونه های باکتریایی که در پاتوژنز بیماریهای پالپ و پری آپیکال نقش دارند، ضروری می باشد. هدف از این مطالعه بررسی فلور باکتریایی 3/1 اپیکالی دندانهای دارای ضایعه پری آپیکال می باشد. در این مطالعه از چهل دندان دارای ضایعه پری آپیکال که مربوط به همین تعداد بیمار بوده و با توجه به طرح درمان کشیده شده بودند، استفاده شد. در یک محیط بسته تحت شرایط تقریباً بیهوازی و در مجاورت جریانی از گاز نتیروژن، با استفاه از دیسک الماسی استریل، ریشه ها از فاصله پنج میلی متری آپکس قطع گردید. بعد از قطع ریشه، با استفاده از یک فایل استریل محتویات موجود در کانال ریشه بر روی دو محیط Blood agar قرار گرفت. یک محیط در شرایط هوازی و محیط دیگر در شرایط بیهوازی (هیدروژن 5%، دی اکسیدکربن 10% و نیتروژن 85%) قرار گرفت. ده دندان نیز که فاقد هر گونه پوسیدگی و یا بیماریهای پریودنتال بوده و به علت درمانهای ارتودنسی کشیده شده بود به عنوان گروه کنترل در نظر گرفته شد و محتویات کانال آنها به ترتیب ذکر شده بر روی محیط Blood agar قرار گرفت. بعد از پیدایش کلنی ها در محیط کشت، نوع گونه های باکتری ها با توجه به خصوصیات مورفولوژیکی کلنی های کشت شده، فنون رنگ آمیزی Gram و استفاده از میکروسکوپ و آزمونهای بیوشیمیایی مشخص شد. از چهل نمونه مورد مطالعه، در 39 نمونه رشد مثبت مشاهده گردید و در تمام 39 نمونه، حداقل یک گونه بیهوازی (اختیاری یا اجباری) رشد کرده بود. در 36 نمونه بیش از یک گونه باکتریایی مشاهده شد که خود تأییدی بر Mix بودن عفونتهای کانال ریشه می باشد. مجموعا 126 باکتری از 17 گونه مختلف، جدا شدند. از این تعداد 62 باکتری بیهوازی اجباری و مجموع باکتری های بیهوازی اختیاری و اجباری 118 عدد (94%) بود. گونه های استرپتوکوک شایعترین باکتری ها بودند. 26 نمونه (65% نمونه ها) حداقل دارای یک گونه باکترویید بودند که خود بیانگر اهمیت باکتروئیدها در ایجاد عفونتهای کانال ریشه می باشد. نکته حائز اهمیت در این مطالعه، تعداد زیاد باکتری های بیهوازی در مقایسه با باکتری های هوازی بود. مقایسه مطالعات انجام شده هم موید این مطلب است. از سوی دیگر، در هیچ یک از دندانهای کنترل، رشد باکتری مشاهده نشد. براساس نتایج حاصل از این مطالعه باکتری ها نقش اساسی در ایجاد عفونت کانال ریشه دارند و عمده باکتری های درگیر باکتری های بی هوازی می باشند.