English: The present study investigated the phylogenetic relationship based on cytochrome b gene sequences among pathogenic Theileria species (spp. ) in Iran, including Theileria annulata and Theileria LESTOQUARDI, along with other data available in GenBank. A total of 136 (cattle) and 80 (sheep) blood samples suspected of piroplasm infection were obtained from six different provinces of Iran. Both microscopic and molecular methods using species-specific primers were used for screening T. annulata and T. LESTOQUARDI positive samples. Finally, the partial cytochrome b gene of 30 T. annulata and 5 T. LESTOQUARDI were amplified, sequenced, and deposited in GenBank. The results indicated that there were 12 different genotypes among T. annulata isolates, while only one genotype was observed among T. LESTOQUARDI isolates. T. LESTOQUARDI infection in cattle was detected in one sample, and no T. annulata and T. LESTOQUARDI coinfection were detected in sheep and cattle. In the phylogenetic tree, different Theileria spp. were placed in separate clades, and the reliability of depicted tree and monophyly of T. annulata and T. LESTOQUARDI ingroups were supported by the bootstrap value of 94% which significantly indicated that these two species evolved from a common ancestor. The tree also showed that these two pathogenic spp. shared a more recent common ancestor, compared to another species of Theileria parasites. To the best of our knowledge, this study is the first phylogenic analysis of pathogenic Theileria spp. in Iran based on the cytochrome b gene sequences. In addition, the first T. LESTOQUARDI cytochrome b gene was sequenced and deposited in GenBank. (French: La pré, sente é, tude a examiné,la relation phylogé, né, tique basé, e sur les sé, quences du gè, ne du cytochrome b parmi les espè, ces pathogè, nes de Theileria (spp. ) en Iran, y compris Theileria annulata et Theileria LESTOQUARDI, ainsi que d'autres donné, es disponibles dans la GenBank. Les é, chantillons de sang de 136 bovins et 80 moutons suspecté, s d'infection par le piroplasme ont é, té,pré, levé, s dans six provinces diffé, rentes d'Iran. Des mé, thodes microscopiques et molé, culaires utilisant des amorces spé, cifiques à,l'espè, ce ont é, té,utilisé, es pour cribler des é, chantillons positifs pour T. annulata et T. LESTOQUARDI. Enfin, le gè, ne partiel du cytochrome b de 30 T. annulata et 5 T. LESTOQUARDI ont é, té,amplifié, s, sé, quencé, s et dé, posé, s dans la GenBank. Les ré, sultats ont indiqué,qu'il y avait 12 gé, notypes diffé, rents parmi les isolats de T. annulata, alors qu'un seul gé, notype a é, té,observé,parmi les isolats de T. LESTOQUARDI. Une infection à, T. LESTOQUARDI chez les bovins a é, té,dé, tecté, e dans un é, chantillon, et aucune co-infection à,T. annulata et T. LESTOQUARDI n'a é, té,dé, tecté, e chez les moutons et les bovins. Dans l'arbre phylogé, né, tique, diffé, rentes Theileria spp. Ont é, té,placé, es dans des clades sé, paré, s, et la fiabilité,de l'arbre repré, senté,et de la monophylie des endogroupes de T. annulata et de T. LESTOQUARDI a é, té,soutenue par la valeur de bootstrap de 94% qui a indiqué,de maniè, re significative que ces deux espè, ces ont é, volué,d'un ancê, tre commun. L'arbre a é, galement montré,que ces deux spp. pathogè, nes partageaient un ancê, tre commun plus ré, cent, comparé,à,une autre espè, ce de parasites Theileria. À,notre connaissance, cette é, tude est la premiè, re analyse phylogé, nique de Theileria spp. pathogè, ne en Iran basé, e sur les sé, quences du gè, ne du cytochrome b. De plus, le premier gè, ne du cytochrome b de T. LESTOQUARDI a é, té,sé, quencé,et dé, posé,dans la GenBank. )