مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

806
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

279
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه با یکدیگر در مارپیج های آلفا

صفحات

 صفحه شروع 469 | صفحه پایان 476

چکیده

 به منظور بررسی تمایل اسیدهای آمینه مجاور (دوتایی) در ساختمانهای دوم از نوع مارپیچ آلفا, مکانهای مورد مطالعه در مارپیچ آلفا بدین شکل انتخاب شدند: N,Ncap,NI,N2,N3,N4,C3,C2,C1,Ccap,C, در این مکانها توالیهای دوتایی مورد بررسی عبارت بودند از N1N2, N2N3, N3N3, N3N4, M1M2, M2M3, C4C3, C3C2, C2C1, C1Ccap, CcapCترجیح قرار گرفتن هر اسید آمینه در هر جایگاه مارپیچ آلفا و ترجیح قرار گرفتن 400 توالی دوتایی درجایگاههای دوتایی مختلف مارپیچ آلفا محاسبه ومقایسه شد, بدین منظور یک بانک اطلاعاتی از مارپیچ آلفا با 3705 مارپیچ طراحی شد و مورد استفاده قرار گرفت. در این بانک مارپیچ ها حداقل دارای 7 اسید آمینه بوده واز مجموعه 696 پروتئین با تشابه کمتر از 25% تشکیل شده بودند. Single local propensity SLP برای همه 20 اسید آمینه در جایگاه های مختلف مارپیچ آلفا محاسبه گردید. علاوه بر این observed Doublet Local propensity DLPO که براساس تکرار اسیدهای آمینه دوتایی استوار است و Expected Doublet local propensity DIPe که به طور مستقیم از روی SLP اندازه گیری میشود نیز محاسبه شد. هرگاه ترجیح قرار گرتفن یک جفت اسید آمینه معین در جایگاه دوتایی خاص از مارپیچ آلفا DLPO بیش از ترجیح محاسبه شده توسط حاصل ضرب جایگاه های تکی در مارپیچ آلفا DLPe باشد یا به عبارت دیگردر صورتی که dlpo>>dlpe باشد. این مسئله تمایل 2 اسید امینه خاص را در مجاورت با یکدیگر در آن جایگاه از مارپیچ آلفا نشان می دهد. نتایج حاصل نشان داد که توالیها یا دوتایی که در آنها DLPE>>DLPE می باشد عبارتند از: Met-Thr در مکان Glu-pro, N Ncap در مکان Pro-Arg, NcapN1 درمکان N1N2 و Lys-His درمکان Thr-Gly, C2C1 در مکان C1Ccap و در نهایت Gin- pro در مکان Ccap علاوه بر این اسید آمینه Gly درمکان Ccap با تمایل زیادی همراه اسید آمینه های یدروفوب در مکان C مشاهده میشود. بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه در مارپیچهای آلفا, می تواند در طراحی مارپیچهای آلفای جدید موجود در پروتئینها و ایجاد تغییرات مورد نظر رد مارپیچهای مورد استفاده قرار گیرد.

چندرسانه ای

  • ثبت نشده است.

    • استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    APA: کپی

    مینوچهر، زرین، و گلیایی، بهرام. (1382). بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه با یکدیگر در مارپیج های آلفا. علوم پزشکی رازی (مجله دانشگاه علوم پزشکی ایران)، 10(35)، 469-476. SID. https://sid.ir/paper/419621/fa

    Vancouver: کپی

    مینوچهر زرین، گلیایی بهرام. بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه با یکدیگر در مارپیج های آلفا. علوم پزشکی رازی (مجله دانشگاه علوم پزشکی ایران)[Internet]. 1382؛10(35):469-476. Available from: https://sid.ir/paper/419621/fa

    IEEE: کپی

    زرین مینوچهر، و بهرام گلیایی، “بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه با یکدیگر در مارپیج های آلفا،” علوم پزشکی رازی (مجله دانشگاه علوم پزشکی ایران)، vol. 10، no. 35، pp. 469–476، 1382، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/419621/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button