مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

900
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

227
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

بررسی فاز عدم تعادل لینکاژی بر روی کروموزوم شماره 6 گاو های نژاد هلشتاین

صفحات

 صفحه شروع 83 | صفحه پایان 98

چکیده

 در مطالعات ارتباطی و انتخاب ژنومی تعیین وسعت عدم تعادل لینکاژی, در تشخیص میزان نشانگر مورد نیاز و اندازه نمونه, اهمیت دارد. دراین پژوهش از 1089 گاو نر هلشتاین نمونه خون و اسپرم تهیه شد و با استفاده از بسته نشانگری K50 شرکت ایلومینا ژنوتیپ 2030 نشانگر بر روی کروموزوم شماره 6 بر مبنای اسمبلی UMD3.1 ژنوم گاو تعیین شد. داده ها برای جهش تک نوکلئوتیدی نادرست و افراد با ژنوتیپ های نامشخص با استفاده از نرم افزار Plink تصحیح شد. پس از تصحیح 1606 نشانگر (%79) باقی ماند. متوسط هتروزیگوسیتی مشاهده شده 0.37 بود و %80 نشانگر ها حداقل فراوانی آللی بالاتر از 0.2 داشتند. عدم تعادل لینکاژی با محاسبه دو پارامتر D’ و r2 از طریق نرم افزار Haploview محاسبه شد. در این مطالعه وسعت عدم تعادل لینکاژی 40kb (r2=0.3) برآورد شد و مقدار r2 در 80kb به 0.2 (سطح متوسط) و در 300kb به 0.1 (سطح پایه) کاهش یافت.اندازه موثر جمعیت در 10 نسل قبل حدود 100 راس بود. علاوه بر این, 49 بلوک هاپلوتیپی با دامنه kb472-18 و پوشش 10.6Mb از کل کروموزم شناسایی شد. نتایج این پژوهش نشان داد که بطور تقریبی بین 70000- 40000 نشانگر یا یک نشانگر به ازاء هر 40-75 kb برای مطالعات ارتباطی کل ژنوم در این جمعیت مورد نیاز است.

چندرسانه ای

  • ثبت نشده است.
  • استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    نصرتی، مریم، طهمورث پور، مجتبی، فونتانزی، لوکا، و نصیری، محمدرضا. (1395). بررسی فاز عدم تعادل لینکاژی بر روی کروموزوم شماره 6 گاو های نژاد هلشتاین. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی، 8(2)، 83-98. SID. https://sid.ir/paper/224515/fa

    Vancouver: کپی

    نصرتی مریم، طهمورث پور مجتبی، فونتانزی لوکا، نصیری محمدرضا. بررسی فاز عدم تعادل لینکاژی بر روی کروموزوم شماره 6 گاو های نژاد هلشتاین. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی[Internet]. 1395؛8(2):83-98. Available from: https://sid.ir/paper/224515/fa

    IEEE: کپی

    مریم نصرتی، مجتبی طهمورث پور، لوکا فونتانزی، و محمدرضا نصیری، “بررسی فاز عدم تعادل لینکاژی بر روی کروموزوم شماره 6 گاو های نژاد هلشتاین،” مجله بیوتکنولوژی کشاورزی، vol. 8، no. 2، pp. 83–98، 1395، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/224515/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button