مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

280
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

124
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

شناسایی بیوانفورماتیک دو ویروس جدید از پسته ایرانی

صفحات

 صفحه شروع 81 | صفحه پایان 85

کلیدواژه

RNA Q1

چکیده

 پسته یکی از گیاهان پر اهمیت اقتصادی بوده و به خانواده Anacardiaceae تعلق دارد. گزارش های مرتبط با عوامل ویروسی در این گیاه به ویروئید کوتولگی رازک, آمپلوویروس آ پسته و ویروس ب پسته محدود است. در مطالعه حاضر به منظور بررسی حضور احتمالی ویروس ها در پسته ایرانی به واکاوی داده های ترنسکریپتومیک عمومی پرداخته شد. دوازده داده با خوانش جفت شده از پایگاه داده SRA قابل دسترس در وب سایت NCBI اخذ گردید. آر ان اِ های گیاهی پس از همردیف سازی داده ها بر روی ژنوم مرجع پسته به وسیله نرم افزار Hisat2, حذف گردید. توالی های غیر گیاهی به وسیله نرم افزارهای MEGAHIT و Trinity مونتاژ و نتیجه ی حاصله به منظور شناسایی توالی های ویروسی توسط نرمافزار BLASTx در توالی های مرجع ویروسی مورد جستجو قرار گرفت. دو ویروس ناشناس متعلق به خانواده Kitaviridae شناسایی و موقتاً ویروس ایکس پسته (MT334618-20) و ویروس وای پسته (MT362605-06) نام گذاری گردیدند. بر اساس ساختار ژنوم, تشابه ژنتیکی و روابط فیلوژنتیک پیشنهاد می شود این دو ویروس ناشناخته به ترتیب به عنوان عضوی از جنس های Higrevirus و Cilevirus در نظر گرفته شوند. تعداد بالای توالی های ویروسی در نمونه های ریشه و برگ, احتمال آلودگی سیستمیک ویروسی ایکس پسته را مطرح می نماید. براساس بررسی های صورت گرفته, این اولین گزارش از توالی ژنومی عامل ویروسی احتمالی بر روی پسته ایرانی می باشد.

چندرسانه ای

  • ثبت نشده است.
  • استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    محمدی، موسی، حسینی، احمد، و نصراله نژاد، سعید. (1400). شناسایی بیوانفورماتیک دو ویروس جدید از پسته ایرانی. بیماریهای گیاهی، 57(1 )، 81-85. SID. https://sid.ir/paper/1059163/fa

    Vancouver: کپی

    محمدی موسی، حسینی احمد، نصراله نژاد سعید. شناسایی بیوانفورماتیک دو ویروس جدید از پسته ایرانی. بیماریهای گیاهی[Internet]. 1400؛57(1 ):81-85. Available from: https://sid.ir/paper/1059163/fa

    IEEE: کپی

    موسی محمدی، احمد حسینی، و سعید نصراله نژاد، “شناسایی بیوانفورماتیک دو ویروس جدید از پسته ایرانی،” بیماریهای گیاهی، vol. 57، no. 1 ، pp. 81–85، 1400، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/1059163/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.
  • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    email sharing button
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button