مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

39
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

0
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

ارزیابی بیوانفورماتیکی ترکیبات فعال 16 گونه گیاهی در مهار آنزیم تیروزین فسفاتاز باکتری استرپتوکوکوس پیوژنز

صفحات

 صفحه شروع 161 | صفحه پایان 173

چکیده

 استرپتوکوکوس پیوژنز نوع a (GAS a) یک باکتری گرم مثبت و مهم ترین گروه استرپتوکوک­ها است. فارنژیت استرپتوکوکی برای جلوگیری از انتقال عفونت ها و عوارض هم زمان با آلودگی و عواقب بعدی به درمان آنتی بیوتیکی مناسب نیاز دارد. هدف از این مطالعه, بررسی بیوانفورماتیکی ترکیبات فعال 16 گونه دارویی بر آنزیم تیروزین فسفاتاز (SP - PTP) است. این پژوهش به روش توصیفی- تحلیلی صورت گرفت. بدین منظور, ابتدا 850 ترکیب فیتوشیمیایی مورد تأیید 16 گونۀ گیاهی شامل آویشن, آلوئه­ورا, میخک, دارچین, زرشک, اکالیپتوس, زنجبیل, زوفا, مریم گلی, گزنه, زردچوبه, بارهنگ, بنفشه, پونه, شیرین بیان و حرا از مقالات جمع آوری و فرمول شیمیایی آن ها از پایگاه داده pubchem دریافت شد. پروتئین مورد نظر از سرور PDB دانلود شد. پس ازآن آماده سازی پروتئین و ترکیبات طبیعی (لیگاند) جهت آنالیز داکینگ مولکولی توسط نرم افزارهای DS Visualizer, Chimera5 و AutoDockTools انجام شد. سپس تعیین جایگاه فعال با استفاده از سرور آنلاینcastp  و نرم افزار PyMOL, داکینگ مولکولی ترکیبات گیاهی و پروتئین مورد نظر با نرم افزار Auto Dock Vina (Trott and Olson 2010) انجام شد. نتایج توسط دو نرم افزار +lig plot و 2.1 Discovery Studio بررسی شد. پس از آن استخراج خصوصیات فیزیکوشیمیایی ترکیبات از سرور  Swiss ADMEو تعیین کلاس سمیت ترکیبات بر اساس قوانین لیپینسکی با استفاده از نرم افزار  Toxtreeانجام شد. در بین ترکیبات مورد بررسی, 19 ترکیب 5′-Methoxyhydnocarpin,Linalyl acetate , 1,3-diisopropylnaphthalene, Ellagic acid, Umbelliferon, Carnosol, Berberine, Berlambine, Tannin, Quercetin, Aesculetin,Apoatropine , Coumarin, emodin و alpha-Bourbonene بالاترین میزان مهارکنندگی آنزیم تیروزین فسفاتاز را نشان دادند. ترکیب alpha-Bourbonene با داشتن مزیت جهش زایی پایین, جذب گوارشی پایینی دارد. از نتایج این پژوهش می توان نتیجه گرفت که از میان مهم ترین ترکیبات مورد مطالعه, ترکیب Linalyl acetate موجود در گیاه بارهنگ با بیش ترین برهمکنش و داشتن خصوصیات مناسبی مانند جهش زایی کم, جذب گوارشی بالا و با پیروی از قانون لیپینسکی می تواند به عنوان یک ترکیب مناسب جهت مهار این باکتری معرفی شود.

چندرسانه ای

  • ثبت نشده است.

    • استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.

    • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button