نسخه جدید سایت SID.ir

مشخصات مقاله

عنوان: 

مطالعه نظری جهش F117L در پروتئین استئوپروتگرین

نوع ارائه: مقاله
نویسنده: مهنام كريم*,موسوي زهرا,پوراحمد راضيه
 
 *دانشکده علوم پايه، دانشگاه شهرکرد
 
عنوان همایش: كنفرانس ملي دستاوردهاي فن آورانه زيست شناسي ايران
نوع همایش:  سازمان ها و مراکز غير دولتي
حامی:  شرکت دانش بنیان پژوهشگران فن آور برنا، دانشگاه مازندران، وزارت کشور
زمان:  1394دوره 1
 
چکیده: 

پوکي استخوان يک بيماري شايع اسکلتي است که با کاهش در استحکام و تراکم بافت استخواني همراه است. استئوپروتگرين (OPG) عضوي از ابر خانواده رسپتوري فاکتور نکروز کننده تومور (TNFR) و يک گليکوپروتئين ترشحي هومودايمر است OPG.موجب مهار مراحل پاياني تشکيل استئوکلاست ها و القاي آپوپتوز آن ها مي شود و يک مهار کننده رقابتي تمايز و فعاليت استئوکلاست ها است. جهش اسيد آمينه لوسين (Leu) به اسيدآمينه فنيل آلانين (Phe) شماره 117 باعث تغيير ساختار OPG انساني و پوکي استخوان مي شود.
هدف: مطالعه نظري تغيير ساختار پروتئين استئوپروتگرين در اثر جهش فنيل آلانين به لوسين 117.
روش کار: ابتدا با گرفتن ترادف پروتئين
OPG و استفاده از چند الگو به کمک برنامه مدلر 10 اقدام به تهيه مدل سه بعدي پروتئين OPG نموديم و از آن به عنوان ساختار شروع در شبيه سازي ديناميک مولکولي استفاده نموديم. شبيه سازي ديناميک مولکولي بمدت 10 نانوثانيه در شرايط NPT در حضور مولکول هاي آب و يون ها انجام شد. سپس با داکينگ مونومر بدست آمده به خودش ساختار ديمر را بدست آورديم و ديمر OPG را با همان شرايط قبلي شبيه سازي کرديم و سپس با ايجاد جهش (F117L) در اين ساختار مجددا شبيه سازي انجام داديم و ساختار آن را با ساختار ديمر طبيعي مقايسه نموديم.
نتيجه: در اثر جهش سطح در دسترس حلال منطقه (
CRD1) (که يکي مناطق اتصال به پروتئين RANKL است) کاهش مي يابد. همچنين ميانگين تعداد پيوندهاي هيدروژني داخل پروتئين در اثر جهش کاهش مي يابد.
بحث: علت ايجاد پوکي استخوان در اثر جهش
F117L احتملا تغيير ساختار پروتئين OPG و کاهش سطح در دسترس حلال منطقه CRD1 مي باشد.

 
کلید واژه: استئوپروتگرين (OPG)، مدلسازي، جهش، شبيه سازي ديناميک مولکولي
 
مقالات نشریه ای مرتبط: 
 
مقالات همایشی مرتبط: 
 
ارتباط خیلی زیاد ارتباط زیاد مرتبط ارتباط کمتر
 
 
بازدید یکساله 67  
 
 
 
آخرین های بلاگ
ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی