5 SID.ir | آناليز ترادف نوكلئوتيدي ناحيه 3 ژنوم جدايه هاي ويروس موزائيك رگه اي گندم در ايران

مشخصات مقاله

عنوان نشریه: 
 
عنوان مقاله: 

آناليز ترادف نوكلئوتيدي ناحيه 3 ژنوم جدايه هاي ويروس موزائيك رگه اي گندم در ايران

 
نویسندگان: 
 
آدرس:  
* بخش گياه پزشكي، دانشكده كشاورزي، دانشگاه شيراز
 
چکیده: 

تعدادي جدايه ويروس موزائيك رگه اي گندم در مناطق مختلف ايران از گندم يا گياهان ديگر جمع آوري و پس از تشخيص سرولوژيكي ويروس، ترادف ناحيه ترجمه نشدني (UTR) در انتهاي 3 ژنوم آن تعيين گرديد. براي اينكار آر. ان. اي. ويروس با mRNA capture kit جذب و cDNA با آغازگر (oligo dT) RCF1 تهيه شد. در واكنش زنجيره اي پليمراز (PCR) با استفاده از جفت آغازگر اختصاصي WSM1/ WSM2 يك قطعه 251 نوكلئوتيدي در ناحيه 3 ژنوم تكثير شد. قطعه تكثير شده در پلاسميد pTZ57R/ T وارد و در باكتري E. coli DH5a همسانه سازي شد. پلاسميد همسانه سازي شده استخراج و ترادف قطعه وارد شده تعيين و با ترادف ساير جدايه هاي WSMV موجود در GenBank مربوط به اروپا، استراليا، آمريكا و تركيه با برنامه CLUSTAL همرديف سازي چند گانه (multiple alignment) شد و درخت فيلوژنتيكي ترسيم گرديد. تشابه نوكلئوتيدي در برنامه MegAlign محاسبه گرديد. براساس رابطه فيلوژنتيكي مشخص شد كه كليه سويه ها و جدايه هاي دنيا در چهار گروه قرار مي گيرند. در اين آناليز جدايه هاي ايران در دو شاخته کاملا مجزا قرار گرفتند. جدايه هاي فلات مرکزي و جنوبي ايران يك گروه كاملا مستقل و جدايي در درخت فيلوژنتيكي تشكيل دادند و جدايه هاي ويروس از شمال غرب كشور همراه با استرين هاي اروپايي در گروه ديگري قرار گرفتند.
براساس اين آناليز دو خط سير تكاملي در ايران ويروس وجود دارد، يكي در شمال غرب كشور و ديگري در فلات مركزي و جنوبي ايران. بر اين اساس تمام جدايه هاي اين ويروس جد مشتركي دارند و از منطقه هلال حاصلخيز سرچشمه گرفته اند و سپس به علت جدايي جغرافيايي در دو مسير تكاملي واگرا شده اند. اين نتايج مي تواند در برنامه هاي يافتن ژنهاي مقاوم و اصلاح گندم مفيد باشد.

 
كلید واژه: 

 
موضوعات مرتبط: 
 
ارجاعات: 
  • ندارد
 
 
مقالات نشریه ای مرتبط: 
 
مقالات همایشی مرتبط: 
 

  بازدید یکساله 122
 
 
آخرین های بلاگ
ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی