5 SID.ir | مقايسه كامپيوتري اپيتوپ هاي نواحي C2-V3-C3 گليكوپروتئين ۱۲۰gp ايزوله ايراني H IV-1 با نواحي همولوگ در زيرگونه هاي گوناگون اين ويروس

مشخصات مقاله

 
عنوان مقاله: 

مقايسه كامپيوتري اپيتوپ هاي نواحي C2-V3-C3 گليكوپروتئين ۱۲۰gp ايزوله ايراني H IV-1 با نواحي همولوگ در زيرگونه هاي گوناگون اين ويروس

 
نویسندگان: 
 
آدرس:  
* دانشگاه شیراز
 
چکیده: 

در تحقيق حاضر اپيتوپ هاي پيش بيني شده در نواحي C2-V3-C3 در ۱۲۰ gp ايزوله ايراني ويروس 1 HIV- با اپيتوپ هاي نواحي مشابه در زيرگونه هاي A تا I اين ويروس مقايسه شده اند. از آن جا كه نواحي اپيتوپ يك پروتئين مناطقي فاقد ساختمان ثانويه و آب دوست هستند که در تماس با محلول آبي اند از اين فاكتورها براي پيش بيني اپيتوپ ها استفاده شد. تعداد نواحي هليكس (١) و شيت ها (٥) در ايزوله ايراني با تعداد آن ها در زيرگونه F و  Aبرابر بود. روش هوبارد ٧ محل بالقوه گليكوزيلاسيون را در ايزوله ايراني تعيين كرد. در تمام زيرگونه هاي ديگر تعداد محل هاي بالقوه گليكوزيلاسيون کم تر از ٧ بود. در تمام ايزوله ها از جمله ايزوله ايراني، يك اپيتوپ در يك ناحيه مشابه پيش بيني شد. در تمام نواحي بررسي شده (به جز ايزوله ايراني و زيرگونه هاي D و H) يك اپيتوپ طويل واحد در ناحيه اي ديگر پيش بيني شد. در زيرگونه H هيچ اپيتوپي در اين ناحيه پيش بيني نشد. در ايزوله ايراني و در زيرگونه D دو اپيتوپ كوتاه در اين ناحيه پيش بيني شد. آناليز كامپيوتري، شباهت ها و تفاوت هاي بين موقعيت اپيتوپ هاي زيرگونه ايراني و ساير ويروس هاي HIV-1 پيش بيني كرد. اگر چه ساختار اوليه ۱۲۰ gp زيرگونه ايراني به زيرگونه B نزديک است، برخي تفاوت ها بين ساختار دوم و سوم اين ويروس و ساب تيپ B پيش بيني مي شوند.

 
کلید واژه: 

 
موضوعات مرتبط: 
 
ارجاعات: 
  • ندارد
 
 
مقالات نشریه ای مرتبط: 
 
مقالات همایشی مرتبط: 
 

  چکیده انگلیسی بازدید یکساله 95
 
 
آخرین های بلاگ
ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی