مشخصات مقاله

عنوان نشریه: 
 
عنوان مقاله: 

برهم کنش بين پپتيد ضدميکروبي پارداکسين با غشاي DPPC به کمک شبيه سازي ديناميک مولکولي

 
نویسندگان: 
 
آدرس:  
* گروه مهندسي علوم زيستي، دانشکده علوم و فنون نوين، دانشگاه تهران، تهران، ايران
 
چکیده: 
اهداف: به دليل ظهور مقاومت هاي دارويي در سلول هاي سرطاني عليه داروهاي رايج، امروزه توجه زيادي به توسعه داروهاي ضدسرطان با مکانيزم هاي عملکرد جديد معطوف شده است. پارداکسين يک پلي پپتيد نوروتوکسيک با خاصيت دوگانه دوستي است. هدف تحقيق حاضر بررسي برهمکنش پپتيد ضدميکروبي پارداکسين با غشاي دولايه DPPC (متشکل از 1و2-دي پالميتوئيل-اس ان-گليسرو-3-فسفاکولين) مدل با استفاده از شبيه سازي هاي ديناميک مولکولي بود. مواد و روش ها: در مطالعه شبيه سازي حاضر شبيه سازي ها براي محيط هاي غشايي مختلف تحت شرايط pH خنثي طراحي شد. ابتدا سيستم عامل لينوکس براي نصب نرم افزار گرافيکي VMD 1. 8. 6 (ديناميک مولکولي ويژوال) به کار رفت. سپس نرم افزار گرومکس 4. 5. 5 براي انجام همه شبيه سازي ها استفاده شد. ساختار pdb پپتيد مورد نظر (1XC0) از بانک اطلاعاتي پروتئين تهيه شد و در شبيه سازي پپتيد-ليپيد از دولايه ليپيدي DPPC استفاده شد. يافته ها: در مدت 500نانوثانيه شبيه سازي، پپتيد به داخل غشا نفوذ کرد. در سيستم DPPC تعداد پيوندهاي هيدروژني بين پپتيد و دولايه ليپيدي ابتدا افزايش پيدا کرد و سپس تا پايان شبيه سازي تقريباً ثابت باقي ماند و متناسب با تعداد پيوندهاي هيدرژني بين پپتيدها و آب به مرور زمان کاهش پيدا کرد. پارداکسين با سطح غشا تماس و به غشا وارد شد. در حضور پپتيد، ضخامت غشا و محدوده هر ليپيد کاهش ولي ضريب نفوذ غشا افزايش يافت. نتيجه گيري: مکانيزم عمل پارداکسين به ساختار دولايه غشايي وابسته است، به طوري که پپتيد پارداکسين با سطح غشاي دولايه ليپيدي DPPC تماس و به آن وارد مي شود.
 
كلید واژه: 

 
موضوعات مرتبط: 
-
 
ارجاعات: 
  • ندارد
 
 
مقالات نشریه ای مرتبط: 
 
مقالات همایشی مرتبط: 
 

  چکیده انگلیسی بازدید یکساله 18
 
 
آخرین های بلاگ
ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی