تجزيه ساختار و تنوع ژنتيکي ارقام جو با استفاده از نشانگرهاي اس. ان. پي

عطايي رضا; غلامحسيني مجيد; احمدي حسين

مشخصات مقاله

عنوان نشریه:

مجله علوم گياهان زراعي ايران (علوم كشاورزي ايران) : تابستان 1397 , دوره 49 , شماره 2 #g00563 ; از صفحه 35 تا صفحه 59 .

عنوان مقاله:

تجزيه ساختار و تنوع ژنتيکي ارقام جو با استفاده از نشانگرهاي اس. ان. پي

نویسندگان:

عطايي رضا*, غلامحسيني مجيد, احمدي حسين

آدرس:

* موسسه تحقيقات اصلاح و تهيه نهال و بذر، سازمان تحقيقات آموزش و ترويج کشاورزي، کرج، ايران

چکیده:

جو يکي از مهم ترين گياهان خانواده غلات است و از نظر اهميت اقتصادي در مقام چهارم دنيا قرار گرفته است. وجود تنوع ژنتيکي اساس برنامه هاي اصلاحي است و براي بهبود گياهان زراعي ضروري است. نشانگرهاي اس. ان. پي به دليل فراواني زياد در ژنوم يکي از بهترين نشانگرها براي مطالعه تنوع ژنتيکي و ساختار جمعيت است. در اين مطالعه 100 رقم جو پاييزه با استفاده از 3964 نشانگر اس. ان. پي با MAF بيشتر از ده درصد مورد ارزيابي قرار گرفت. دامنه شاخص PIC در کل جمعيت از 0. 19 تا 0. 5 با ميانگين 0. 39بود. مقدار اين شاخص براي اغلب نشانگرها (3352 نشانگر) بيشتر از 0. 25 بود. ميانگين شاخص PIC بر روي کروموزوم هاي مختلف از 0. 37 (کروموزوم هاي شماره 2 و 5) تا 0. 42(کروموزوم هاي شماره 3 و 7) متغير بود. تعيين ساختار جمعيت نشان داد که ژنو تيپ ها بر اساس نشانگرهاي مورد استفاده در دو زيرگروه قرار مي گيرند که با مورفولوژي دورديفه يا شش رديفه بودن سنبله مطابقت داشت. تجزيه واريانس مولکولي و تعيين شاخص Fst در نواحي از ژنوم که باعث تمايز دو زيرجمعيت شده اند، نشان داد اين مناطق ژنومي با ژن هاي کنترل کننده مورفولوژي سنبله هم مکان هستند. ميانگين عدم تعادل لينکاژي با افزايش فاصله ژنتيکي کاهش يافت و در داخل زيرگروه ها بيشتر از عدم تعادل موجود در کل جمعيت بود. عدم تعادل ژنتيکي در ارقام شش رديفه نسبت به ارقام دو رديفه روند کاهشي سريع تري داشت. اين پژوهش نشان داد تنوع ژنتيکي قابل ملاحظه اي در ارقام جو پاييزه وجود دارد و مي توان از آن در برنامه هاي اصلاحي استفاده کرد.

كلید واژه:

تنوع ژنتيکي(Q2)ساختار جمعيت(Q1)عدم تعادل لينکاژي(Q1)اس.ان.پي(Q1)