بررسي ويژگي هاي مولکولي يک جدايه ي ويروس واي سيب زميني جداشده از محصول گوجه فرنگي از شهرستان يزد بر پايه ي توالي قسمت هايي از ژنوم

ميررحيمي سيدرضا; حسيني ثمين; حسيني احمد; اسمعيل زاده حسيني سيدعليرضا

مشخصات مقاله

عنوان نشریه:

دانش گياهپزشكي ايران (علوم كشاورزي ايران) : پاييز و زمستان 1395 , دوره 47 , شماره 2 #f00539 ; از صفحه 189 تا صفحه 199 .

عنوان مقاله:

بررسي ويژگي هاي مولکولي يک جدايه ي ويروس واي سيب زميني جداشده از محصول گوجه فرنگي از شهرستان يزد بر پايه ي توالي قسمت هايي از ژنوم

نویسندگان:

ميررحيمي سيدرضا, حسيني ثمين*, حسيني احمد, اسمعيل زاده حسيني سيدعليرضا

آدرس:

* گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ولی عصر، رفسنجان

چکیده:

گوجه فرنگي (Lycopersicum esculentum Mill. ) يکي از محصولات مهم در ايران و بسياري از کشورها است. بر پايه ي يک بررسي انجام شده در سال 1392 ويروس واي سيب زميني به عنوان ويروس غالب آلوده کننده ي گوجه فرنگي در شهرستان يزد معرفي شده بود. در اين پژوهش قسمت هايي از ژنوم يک جدايه ي انتخابي از اين ويروس با نام جدايه ي T5 افزونش و توالي يابي شد. پس از استخراج RNA کل از نمونه ي T5، با استفاده از آزمون RT-PCR نواحي مختلف CP، NIb و P1 به کمک جفت آغازگرهاي CPf/CPr، M4T/Sprimer و P1/P2 افزونش و به ترتيب سه قطعه به طول 824، 1700 و 837 جفت بازي توالي يابي شد. نتايج به دست آمده از بررسي و مقايسه ي توالي آمينواسيدي و نوکلئوتيدي نواحي P1، CP و NIb با ديگر توالي هاي موجود در بانک ژن، نشان داد که جدايه ي T5 متعلق به سويه يNTN است.

کلید واژه:

ژن P1 و پروتئين پوششي(Q1)گوجه فرنگي(Q2)PVY(Q1)RT-PCR(Q2)