مشخصات مقاله عنوان نشریه: علوم دامي ايران ( علوم كشاورزي ايران) اطلاعات شماره: بهار 1397 , دوره 49 , شماره 1 ; از صفحه 145 تا صفحه 157 . عنوان مقاله: تأثير مستندسازي نژادگان و معماري هاي مختلف ژنگاني بر عملکرد روش هاي جنگل تصادفي و بيز آستانه اي A در پيش بيني ژنگاني نویسندگان: نادري يوسف* آدرس: * دانشگاه آزاد آستارا چکیده: انتخاب ژنگاني (ژنومي) با بهره گيري از مستندسازي (ايمپيوتيشن) مي تواند نقش مهمي در افزايش بهره وري اقتصادي و پيشرفت ژنتيکي صفات آستانه اي ايفا کند. هدف اين تحقيق بررسي درستي مستندسازي و تأثير آن در سطح زير منحني مشخصه ي عملکرد (AUROC) ارزيابي ژنگاني روش هاي بيز آستانه اي A(TBA) و جنگل تصادفي (RF) در ويژگي هاي آستانه اي با معماري هاي مختلف ژنگاني است. داده هاي ژنگاني براي سطوح متفاوت وراثت پذيري (1/0 و 3/0)، سطوح مختلف LD (135/0 و 295/0) و شمار متفاوت جايگاه هاي ويژگي هاي کمي (108 و 1080) روي کروموزم 27 کروموزم همانند سازي شدند. براي همانندسازي شرايط واقعي براي هر پيش فرض (سناريو)، از بين 54 هزار نشانگر همانندسازي شده به طور تصادفي اقدام به حذف 50 درصد و 90 درصد نشانگرها کرده و در مرحله ي بعد با مستندسازي اقدام به پيش بيني نژادگان (ژنوتيپ) نشانگرها کرده و درستي مستندسازي ارزيابي شد. در گام آخر، نژادگان هاي اصلي و مستند شده با استفاده از روش TBA و RF براي ارزيابي AUROC استفاده شدند. با افزايش سطح LD و کاهش ميزان حذف نشانگرها، درستي مستندسازي بهبود يافت. ميانگين AUROC پيش فرض هاي همانندسازي شده براي جنگل تصادفي و TBA به ترتيب 64/0 و 66/0 بود. استفاده از نژادگان هاي مستند شده با ميزان حذف 50 درصد و 90 درصد، به ترتيب AUROC را به ميزان 013/0 و 02/0 براي RF و 018/0 و 026/0 براي TBA کاهش داد. به رغم AUROC بالاي روش بيز آستانه اي A در پيش فرض هاي مختلف، روش جنگل تصادفي عملکرد بهتري در شمار بالاي QTL نشان داد. به طورکلي استفاده از نژادگان هاي مستند شده (k5) مي تواند راهکار مهمي براي کاهش هزينه هاي ارزيابي ژنگاني باشد. کلید واژه: درستي مستندسازي(Q1)نبود تعادل پيوستگي(Q1)ميزان نژادگان ازدست رفته(Q1)همانندسازي(Q1)AUROC(Q1) چارک 1 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک اول تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع خیلی زیاد است. چارک 2 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک دوم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع زیاد است. چارک 3 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک سوم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع کم است. چارک 4 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک چهارم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع خیلی کم است. موضوعات مرتبط: - ارجاعات: ندارد مقالات نشریه ای مرتبط: تأثير اسناد کردن و تراکم نشانگري در بهبود درستي ارزيابي هاي ژنگانيتأثير راهبرد هاي مختلف انتخاب حيوانات گروه مرجع بر درستي ارزيابي ژنگاني براي صفات با وراثت پذيري متوسط در جمعيت گاو شيريبرآورد صحت ارزش هاي اصلاحي صفات پيچيده در جمعيت هاي بدون شجره با استفاده از نشانگرهاي متراکمژنگان شناسی از آزمایشگاه تا مزرعه: تولید نژادگان های گندم پرمحصول و متحمل به تنش های محیطیبررسي هاي مقايسه اي صفات مورفو - بيولوژيكي در توده اي از گردوهاي ايراني (.Juglans regia L) براي انتخاب نژادگان هاي برتر مقالات همایشی مرتبط: اهمیت مستند سازی در اورژانس ضرورت و روش های بهره گیری از فناوری های نوین در مستندسازی کاوش های باستان شناسیشناسایی و مستندسازی فرایندهای تخصصی مدیریت منابع انسانی بمنظور استقرار نظام مدیریت بهره ور در دانشگاه علوم پزشکی شهرکردمستندسازی معماری نرم افزار: روش چابک در مقابل روش سنتیبررسی سطح آگاهی و نگرش دانشجویان مقطع اینترنی دانشکده های علوم پزشکی شیراز و فسا (تیپ 1 و تیپ 3)، از اصول مستندسازی پرونده پزشکی در نیمه دوم سال 1391 ویدئوهای مرتبط از مکتبخونه چکیده انگلیسی بازدید یکساله 35 آخرین های بلاگ تکنیک های جستجو در گوگل: استفاده از عملگر Notشماره گذاری خطوط در وردمعرفی 10 موضوع داغ در بیست حوزه علمی بر اساس پایگاه مرکز اطلاعات علمیتست آنلاین کروناآشنایی با شاخص های hI ،hf و hm از خانواده شاخص هرشچطور مطالب را تنها در یک سایت خاص جستجو کنیم ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی