مشخصات مقاله عنوان نشریه: علوم دامي ايران ( علوم كشاورزي ايران) : بهار 1397 , دوره 49 , شماره 1 #r00388 ; از صفحه 145 تا صفحه 157 . عنوان مقاله: تأثير مستندسازي نژادگان و معماري هاي مختلف ژنگاني بر عملکرد روش هاي جنگل تصادفي و بيز آستانه اي A در پيش بيني ژنگاني نویسندگان: نادري يوسف* آدرس: * دانشگاه آزاد آستارا چکیده: انتخاب ژنگاني (ژنومي) با بهره گيري از مستندسازي (ايمپيوتيشن) مي تواند نقش مهمي در افزايش بهره وري اقتصادي و پيشرفت ژنتيکي صفات آستانه اي ايفا کند. هدف اين تحقيق بررسي درستي مستندسازي و تأثير آن در سطح زير منحني مشخصه ي عملکرد (AUROC) ارزيابي ژنگاني روش هاي بيز آستانه اي A(TBA) و جنگل تصادفي (RF) در ويژگي هاي آستانه اي با معماري هاي مختلف ژنگاني است. داده هاي ژنگاني براي سطوح متفاوت وراثت پذيري (1/0 و 3/0)، سطوح مختلف LD (135/0 و 295/0) و شمار متفاوت جايگاه هاي ويژگي هاي کمي (108 و 1080) روي کروموزم 27 کروموزم همانند سازي شدند. براي همانندسازي شرايط واقعي براي هر پيش فرض (سناريو)، از بين 54 هزار نشانگر همانندسازي شده به طور تصادفي اقدام به حذف 50 درصد و 90 درصد نشانگرها کرده و در مرحله ي بعد با مستندسازي اقدام به پيش بيني نژادگان (ژنوتيپ) نشانگرها کرده و درستي مستندسازي ارزيابي شد. در گام آخر، نژادگان هاي اصلي و مستند شده با استفاده از روش TBA و RF براي ارزيابي AUROC استفاده شدند. با افزايش سطح LD و کاهش ميزان حذف نشانگرها، درستي مستندسازي بهبود يافت. ميانگين AUROC پيش فرض هاي همانندسازي شده براي جنگل تصادفي و TBA به ترتيب 64/0 و 66/0 بود. استفاده از نژادگان هاي مستند شده با ميزان حذف 50 درصد و 90 درصد، به ترتيب AUROC را به ميزان 013/0 و 02/0 براي RF و 018/0 و 026/0 براي TBA کاهش داد. به رغم AUROC بالاي روش بيز آستانه اي A در پيش فرض هاي مختلف، روش جنگل تصادفي عملکرد بهتري در شمار بالاي QTL نشان داد. به طورکلي استفاده از نژادگان هاي مستند شده (k5) مي تواند راهکار مهمي براي کاهش هزينه هاي ارزيابي ژنگاني باشد. كلید واژه: درستي مستندسازي(Q1)نبود تعادل پيوستگي(Q1)ميزان نژادگان ازدست رفته(Q1)همانندسازي(Q1)AUROC(Q1) چارک 1 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک اول تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع خیلی زیاد است. چارک 2 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک دوم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع زیاد است. چارک 3 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک سوم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع کم است. چارک 4 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک چهارم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع خیلی کم است. موضوعات مرتبط: - ارجاعات: ندارد مقالات نشریه ای مرتبط: بررسي هاي مقايسه اي صفات مورفو - بيولوژيكي در توده اي از گردوهاي ايراني (.Juglans regia L) براي انتخاب نژادگان هاي برترتأثير راهبرد هاي مختلف انتخاب حيوانات گروه مرجع بر درستي ارزيابي ژنگاني براي صفات با وراثت پذيري متوسط در جمعيت گاو شيريتأثير اسناد کردن و تراکم نشانگري در بهبود درستي ارزيابي هاي ژنگانيژنگان شناسي از آزمايشگاه تا مزرعه: توليد نژادگان هاي گندم پرمحصول و متحمل به تنش هاي محيطيبرآورد صحت ارزش هاي اصلاحي صفات پيچيده در جمعيت هاي بدون شجره با استفاده از نشانگرهاي متراکم مقالات همایشی مرتبط: مستندسازي معماري نرم افزار: روش چابک در مقابل روش سنتيشناسايي و مستندسازي فرايندهاي تخصصي مديريت منابع انساني بمنظور استقرار نظام مديريت بهره ور در دانشگاه علوم پزشکي شهرکرداهميت مستند سازي در اورژانس بررسي سطح آگاهي و نگرش دانشجويان مقطع اينترني دانشکده هاي علوم پزشکي شيراز و فسا (تيپ 1 و تيپ 3)، از اصول مستندسازي پرونده پزشکي در نيمه دوم سال 1391ضرورت و روش هاي بهره گيري از فناوري هاي نوين در مستندسازي کاوش هاي باستان شناسي ویدئوهای مرتبط از مکتب‌خونه چکیده انگلیسی بازدید یکساله 21 آخرین های بلاگ با کد رایگان QR میزان استفاده از ارائه خود را افزایش دهیدمحققان پر استناد ایران در سال 2019موضوعات جدید علمی را استخراج کنیدبا سرویس رایگان موضوعات مرتبط در ساینس دایرکت آشنا شویمبا پابلونز: مقالات علمی خود را به صورت رایگان از وب آو ساینس رصد کنیمچگونه استنادات خود را افزایش دهیم؟ ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی