برای اطلاع از آخرین مقالات علمی و اخبار کرونا(COVID-19) کلیک کنید

مشخصات مقاله

عنوان نشریه: 
 
اطلاعات شماره: 
بهار 1397 , دوره  49 , شماره  1 ; از صفحه 73 تا صفحه 81 .
 
عنوان مقاله: 

تأثير اسناد کردن و تراکم نشانگري در بهبود درستي ارزيابي هاي ژنگاني

 
نویسندگان: 
 
آدرس:  
* پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج
 
چکیده: 
با دسترسي به اطلاعات نشانگرهاي تک نوکلئوتيدي (SNP )، پيش بيني شايستگي ژنتيکي افراد بدون اطلاعات پديدگاني (فنوتيپي) با استفاده از ارزيابي ژنگاني (ژنومي) امکان پذير شده است. ليکن، استفاده از تراشه (چيپ) هاي متراکم براي ارزيابي همه ي افراد جمعيت مقرون به صرفه نيست. براي دستيابي به بيشترين بازدهي در بررسي هاي ژنگاني مي توان گروهي از حيوان ها را با تراشه هاي با تراکم بالا و ديگر افراد را با تراشه هاي کم تراکم تعيين نژادگان (ژنوتيپ) کرد، سپس آن ها را به تراکم بالا اسناد (ايمپيوت) کرد. در اين بررسي، تأثير سه تراشه ي کم تراکم (1k، 2k و 4k)، اسناد شده به تراکم بالاي 10k و رابطه ي خويشاوندي بين جمعيت مرجع و جمعيت هاي تأييد بر درستي ارزيابي ژنگاني و نيز همبستگي ارزش هاي اصلاحي برآورد شده در تراشه هاي مختلف با استفاده از داده ي همانند سازي شده، بررسي شد. براي ساختن تراشه هاي کم تراکم، 10، 20 و 40 درصد از نشانگرهاي 10k به صورت تصادفي انتخاب شدند. اسناد کردن (ايمپيوتيشن) با استفاده از نرم افزار FImpute صورت گرفت. به طورکلي با افزايش تراکم نشانگري، همبستگي بين ارزش هاي اصلاحي برآورد شده به دست آمده از تراشه هاي مختلف افزايش پيدا کرد. به گونه اي که، درستي ارزيابي ژنگاني تراشه ي کم تراکم 4k و تراشه ي متراکم 10k همسان بودند. همچنين پس از اسناد کردن نژادگان هاي تراشه ي 4k به 10k، تفاوتي بين درستي ارزيابي هاي ژنگاني ايجاد نشد. با افزايش فاصله ي جمعيت مرجع و جمعيت هاي تأييد، درستي اسناد کردن کاهش يافت.
 
کلید واژه: 

 
موضوعات مرتبط: 
 
 
مقالات نشریه ای مرتبط:  
 
مقالات همایشی مرتبط: 
 
مقالات بین المللی مرتبط: 
 
ارتباط خیلی زیاد ارتباط زیاد مرتبط ارتباط کمتر
 
ارجاعات: 
  • ثبت نشده است
 
استنادات: 
  • ثبت نشده است
 
+جهت ارجاع به این مقاله کلیک کنید(Cite).
APA : کپی

پرنا، ن.، و نجاتی جوارمی، ا.، و صادقی، م.، و عبدالهی آرپناهی، ر. (1397). تأثیر اسناد کردن و تراکم نشانگری در بهبود درستی ارزیابی های ژنگانی. علوم دامی ایران ( علوم کشاورزی ایران), 49(1 ), 73-81. https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=467307



Vancouver : کپی

پرنا ناهید، نجاتی جوارمی اردشیر، صادقی مصطفی، عبدالهی آرپناهی رستم. تأثیر اسناد کردن و تراکم نشانگری در بهبود درستی ارزیابی های ژنگانی. علوم دامی ایران ( علوم کشاورزی ایران). 1397 [cited 2022January25];49(1 ):73-81. Available from: https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=467307



IEEE : کپی

پرنا، ن.، نجاتی جوارمی، ا.، صادقی، م.، عبدالهی آرپناهی، ر.، 1397. تأثیر اسناد کردن و تراکم نشانگری در بهبود درستی ارزیابی های ژنگانی. علوم دامی ایران ( علوم کشاورزی ایران), [online] 49(1 ), pp.73-81. Available: https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=467307.



 

 
چکیده انگلیسی بازدید یکساله 45 مباني نظري و تجربي ونداليسم: مروري بر يافته هاي يك تحقيق
 
آخرین های بلاگ
ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی