مشخصات مقاله عنوان نشریه: علوم دامي ايران ( علوم كشاورزي ايران) : بهار 1397 , دوره 49 , شماره 1 #r00388 ; از صفحه 73 تا صفحه 81 . عنوان مقاله: تأثير اسناد کردن و تراکم نشانگري در بهبود درستي ارزيابي هاي ژنگاني نویسندگان: پرنا ناهيد, نجاتي جوارمي اردشير, صادقي مصطفي*, عبدالهي آرپناهي رستم آدرس: * پرديس کشاورزي و منابع طبيعي، دانشگاه تهران، کرج چکیده: با دسترسي به اطلاعات نشانگرهاي تک نوکلئوتيدي (SNP )، پيش بيني شايستگي ژنتيکي افراد بدون اطلاعات پديدگاني (فنوتيپي) با استفاده از ارزيابي ژنگاني (ژنومي) امکان پذير شده است. ليکن، استفاده از تراشه (چيپ) هاي متراکم براي ارزيابي همه ي افراد جمعيت مقرون به صرفه نيست. براي دستيابي به بيشترين بازدهي در بررسي هاي ژنگاني مي توان گروهي از حيوان ها را با تراشه هاي با تراکم بالا و ديگر افراد را با تراشه هاي کم تراکم تعيين نژادگان (ژنوتيپ) کرد، سپس آن ها را به تراکم بالا اسناد (ايمپيوت) کرد. در اين بررسي، تأثير سه تراشه ي کم تراکم (1k، 2k و 4k)، اسناد شده به تراکم بالاي 10k و رابطه ي خويشاوندي بين جمعيت مرجع و جمعيت هاي تأييد بر درستي ارزيابي ژنگاني و نيز همبستگي ارزش هاي اصلاحي برآورد شده در تراشه هاي مختلف با استفاده از داده ي همانند سازي شده، بررسي شد. براي ساختن تراشه هاي کم تراکم، 10، 20 و 40 درصد از نشانگرهاي 10k به صورت تصادفي انتخاب شدند. اسناد کردن (ايمپيوتيشن) با استفاده از نرم افزار FImpute صورت گرفت. به طورکلي با افزايش تراکم نشانگري، همبستگي بين ارزش هاي اصلاحي برآورد شده به دست آمده از تراشه هاي مختلف افزايش پيدا کرد. به گونه اي که، درستي ارزيابي ژنگاني تراشه ي کم تراکم 4k و تراشه ي متراکم 10k همسان بودند. همچنين پس از اسناد کردن نژادگان هاي تراشه ي 4k به 10k، تفاوتي بين درستي ارزيابي هاي ژنگاني ايجاد نشد. با افزايش فاصله ي جمعيت مرجع و جمعيت هاي تأييد، درستي اسناد کردن کاهش يافت. كلید واژه: رابطه ي خويشاوندي(Q1)نشانگر(Q1)همانند سازي(Q1) چارک 1 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک اول تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع خیلی زیاد است. چارک 2 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک دوم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع زیاد است. چارک 3 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک سوم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع کم است. چارک 4 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک چهارم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع خیلی کم است. موضوعات مرتبط: - ارجاعات: ندارد مقالات نشریه ای مرتبط: برآورد صحت ارزش هاي اصلاحي صفات پيچيده در جمعيت هاي بدون شجره با استفاده از نشانگرهاي متراکمارزيابي و درمان تنگيهاي تراشه ناشي از ضايعات خوش خيم و بدخيم تيرویيد و گزارش موارد عمل شدهتأثير مستندسازي نژادگان و معماري هاي مختلف ژنگاني بر عملکرد روش هاي جنگل تصادفي و بيز آستانه اي A در پيش بيني ژنگانيتأثير راهبرد هاي مختلف انتخاب حيوانات گروه مرجع بر درستي ارزيابي ژنگاني براي صفات با وراثت پذيري متوسط در جمعيت گاو شيريبررسي تاثير استفاده از ليدوکائين موضعي روي تيغه لارنگوسکوپ، تراشه و کاف لوله تراشه بر تغييرات فشارخون و ضربان قلب حين لارنگوسکوپي و لوله گذاري تراشه و مقايسه آن با گروه شاهد مقالات همایشی مرتبط: معماري بازپيکربندي شونده براي مسيرياب شبکه روي تراشه سه بعديتاثير نانو رس مونتموريلونيت بر روي مقاومت فشار موازي با محور طولي چندسازه هاي چوبي ساخته شده از رزين اوره فرمالدهيد بررسي روند آزمون تراشه هاي سيستمي بر اساس استاندارد IEEE 1500اثر جهت قرار گرفتن تراشه ها، زمان پرس و ميزان چسب مصرفي بر مقاومت خمشي تخته تراشه هاي ساخته شده از ضايعات روکش و تخته لايهتاثير تغييران پهناي باند بر روي لازمه هاي مساحتي و توان مصرفي يک مسيرياب شبکه بر روي تراشه با طراحي منعطف ویدئوهای مرتبط از مکتبخونه چکیده انگلیسی بازدید یکساله 15 آخرین های بلاگ با کد رایگان QR میزان استفاده از ارائه خود را افزایش دهیدمحققان پر استناد ایران در سال 2019موضوعات جدید علمی را استخراج کنیدبا سرویس رایگان موضوعات مرتبط در ساینس دایرکت آشنا شویمبا پابلونز: مقالات علمی خود را به صورت رایگان از وب آو ساینس رصد کنیمچگونه استنادات خود را افزایش دهیم؟ ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی