مشخصات مقاله عنوان نشریه: علوم دامي ايران ( علوم كشاورزي ايران) اطلاعات شماره: بهار 1397 , دوره 49 , شماره 1 ; از صفحه 73 تا صفحه 81 . عنوان مقاله: تأثير اسناد کردن و تراکم نشانگري در بهبود درستي ارزيابي هاي ژنگاني نویسندگان: پرنا ناهيد, نجاتي جوارمي اردشير, صادقي مصطفي*, عبدالهي آرپناهي رستم آدرس: * پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج چکیده: با دسترسي به اطلاعات نشانگرهاي تک نوکلئوتيدي (SNP )، پيش بيني شايستگي ژنتيکي افراد بدون اطلاعات پديدگاني (فنوتيپي) با استفاده از ارزيابي ژنگاني (ژنومي) امکان پذير شده است. ليکن، استفاده از تراشه (چيپ) هاي متراکم براي ارزيابي همه ي افراد جمعيت مقرون به صرفه نيست. براي دستيابي به بيشترين بازدهي در بررسي هاي ژنگاني مي توان گروهي از حيوان ها را با تراشه هاي با تراکم بالا و ديگر افراد را با تراشه هاي کم تراکم تعيين نژادگان (ژنوتيپ) کرد، سپس آن ها را به تراکم بالا اسناد (ايمپيوت) کرد. در اين بررسي، تأثير سه تراشه ي کم تراکم (1k، 2k و 4k)، اسناد شده به تراکم بالاي 10k و رابطه ي خويشاوندي بين جمعيت مرجع و جمعيت هاي تأييد بر درستي ارزيابي ژنگاني و نيز همبستگي ارزش هاي اصلاحي برآورد شده در تراشه هاي مختلف با استفاده از داده ي همانند سازي شده، بررسي شد. براي ساختن تراشه هاي کم تراکم، 10، 20 و 40 درصد از نشانگرهاي 10k به صورت تصادفي انتخاب شدند. اسناد کردن (ايمپيوتيشن) با استفاده از نرم افزار FImpute صورت گرفت. به طورکلي با افزايش تراکم نشانگري، همبستگي بين ارزش هاي اصلاحي برآورد شده به دست آمده از تراشه هاي مختلف افزايش پيدا کرد. به گونه اي که، درستي ارزيابي ژنگاني تراشه ي کم تراکم 4k و تراشه ي متراکم 10k همسان بودند. همچنين پس از اسناد کردن نژادگان هاي تراشه ي 4k به 10k، تفاوتي بين درستي ارزيابي هاي ژنگاني ايجاد نشد. با افزايش فاصله ي جمعيت مرجع و جمعيت هاي تأييد، درستي اسناد کردن کاهش يافت. کلید واژه: رابطه ي خويشاوندي(Q1)نشانگر(Q1)همانند سازي(Q1) چارک 1 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک اول تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع خیلی زیاد است. چارک 2 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک دوم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع زیاد است. چارک 3 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک سوم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع کم است. چارک 4 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک چهارم تازگی است. یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع خیلی کم است. موضوعات مرتبط: - ارجاعات: ندارد مقالات نشریه ای مرتبط: بررسي تاثير استفاده از ليدوکائين موضعي روي تيغه لارنگوسکوپ، تراشه و کاف لوله تراشه بر تغييرات فشارخون و ضربان قلب حين لارنگوسکوپي و لوله گذاري تراشه و مقايسه آن با گروه شاهدتأثير مستندسازي نژادگان و معماري هاي مختلف ژنگاني بر عملکرد روش هاي جنگل تصادفي و بيز آستانه اي A در پيش بيني ژنگانيارزيابي و درمان تنگيهاي تراشه ناشي از ضايعات خوش خيم و بدخيم تيرویيد و گزارش موارد عمل شدهبرآورد صحت ارزش هاي اصلاحي صفات پيچيده در جمعيت هاي بدون شجره با استفاده از نشانگرهاي متراکمتأثير راهبرد هاي مختلف انتخاب حيوانات گروه مرجع بر درستي ارزيابي ژنگاني براي صفات با وراثت پذيري متوسط در جمعيت گاو شيري مقالات همایشی مرتبط: اثر جهت قرار گرفتن تراشه ها، زمان پرس و میزان چسب مصرفی بر مقاومت خمشی تخته تراشه های ساخته شده از ضایعات روکش و تخته لایهتاثیر نانو رس مونتموریلونیت بر روی مقاومت فشار موازی با محور طولی چندسازه های چوبی ساخته شده از رزین اوره فرمالدهیدبررسی روند آزمون تراشه های سیستمی بر اساس استاندارد IEEE 1500معماری بازپیکربندی شونده برای مسیریاب شبکه روی تراشه سه بعدیتاثیر تغییران پهنای باند بر روی لازمه های مساحتی و توان مصرفی یک مسیریاب شبکه بر روی تراشه با طراحی منعطف ویدئوهای مرتبط از مکتبخونه چکیده انگلیسی بازدید یکساله 40 آخرین های بلاگ معرفی 10 موضوع داغ در بیست حوزه علمی بر اساس پایگاه مرکز اطلاعات علمیتست آنلاین کروناآشنایی با شاخص های hI ،hf و hm از خانواده شاخص هرشچطور مطالب را تنها در یک سایت خاص جستجو کنیمآموزش جستجوی تصویر در گوگلبرقراری پیوند میان ارجاعات درون متنی و آخر متن ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی