به منظور بررسي تاثير کودهاي آلي و شيميايي بر خصوصيات عملکرد و کيفيت محصول خرفه، آزمايشي در مزرعه تحقيقاتي دانشگاه شهرکرد در سال 1393 اجرا شد. تيمارهاي مختلف کودي شامل 13 تن در هکتار کود مرغي (BLn)، 14.4 تن در هکتار کود مرغي (BLp)،39 تن در هکتار کود گاوي (CMn)، 16.87 تن در هکتار کود گاوي+ 150 کيلوگرم در هکتار اوره (CMp+U)، چهار سطح کود شيميايي برابر تيمارهاي آلي، 260+86 کيلوگرم در هکتار به ترتيب اوره و سوپرفسفات تريپلCF (BLn) ،100+287 کيلوگرم در هکتار به ترتيب اوره و سوپرفسفات تريپل (BLp) CF،200+260 کيلوگرم در هکتار به ترتيب اوره و سوپرفسفات تريپل(CMn) CF،100+260 کيلوگرم در هکتار به ترتيب اوره و سوپرفسفات تريپل CF (CMp+U) و شاهد (عدم مصرف کود) (C) بودند. نتايج نشان داد که تفاوت معني داري در ارتفاع بوته تيمار (BLn) CF (55.43 سانتي متر) با تيمارهاي شيمياييCF (BLp) ، CF (CMn) و تيمارهاي آلي BLn و BLp وجود نداشت. براي تعداد دانه در کپسول نيز تيمارهاي BLp و BLn (به ترتيب 180.48 و 167.78 دانه) اختلاف معني داري با هم نشان ندادند. همچنين وزن هزاردانه در تيمارهاي BLp، BLn و CMn به ترتيب با ميانگين 0.44، 0.43 و 0.42 گرم اختلاف معني داري با هم نداشتند، همين طور تيمارهاي CMn،(BLn) CF و CMp+U نيز تفاوت معني داري را در وزن هزاردانه نشان ندادند. عملکرد دانه، ميزان روغن و عملکرد روغن تيمار BLp افزايش معني داري نسبت به ساير کرت هاي دريافت کننده کود و شاهد (عدم مصرف کود) داشت. ميزان امگا-3 در تيمارهاي BLp و BLn به ترتيب 85% و 79% بيشتر از تيمار شاهد (عدم مصرف کود) بود. به طور کلي، استفاده از کود مرغي علاوه بر افزايش قابل ملاحظه عملکرد دانه خرفه مي تواند در افزايش کيفيت روغن اين گياه دارويي نيز موثر باشد.