3 SID.ir | بررسي تفاوت هاي ژنتيكي پاتوتايپ هاي زنگ قهوه اي گندم ايران بر اساس تعيين توالي ناحيه ITS1

مشخصات مقاله

عنوان نشریه: 
 
عنوان مقاله: 

بررسي تفاوت هاي ژنتيكي پاتوتايپ هاي زنگ قهوه اي گندم ايران بر اساس تعيين توالي ناحيه ITS1

 
نویسندگان: 
 
آدرس:  
* دانشگاه آزاد اسلامی، واحد جهرم، گروه بیماری شناسی گیاهی، جهرم
 
چکیده: 

سابقه و هدف: بيماري زنگ قهوه اي (زنگ برگي) گندم يكي از بيماري هاي مهم گندم است كه توسط قارچ Puccinia triticina Erikson ايجاد مي شود. در سال هاي اخير توالي يابي نواحي مختلف DNA ريبوزومي به ويژه ناحيه ITS1 به منظور بررسي تفاوت هاي ژنتيكي پاتوتايپ هاي عوامل بيماريزاي زنگ هاي مختلف گندم مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از انجام اين پژوهش، بررسي تشابهات و تفاوت هاي موجود بين پاتوتايپ هاي عوامل بيماريزاي زنگ قهوه اي گندم در مناطق مختلف جغرافيا يي ايران بر اساس توالي يابي ناحيه ITS1 از DNA ريبوزومي بود.
مواد و روش ها: در ابتدا
DNA يوريدينيوسپورهاي پاتوتايپ هاي عامل بيماري زنگ قهوه اي گندم استخراج گرديد. سپس از تكنيك PCR و پرايمرهاي  ITS5و Rust2 به منظور تکثير ناحيه ITS1 استفاده شد. محصولات PCR تعيين توالي شدند و شماره دسترسي آنها در بانك ژن ثبت گرديد. با استفاده از نرم افزار هاي MEGA4 و DNA MAN هم ترازي توالي ها و مقايسه توالي هاي تكرار شونده در طول ناحيه ITS1 انجام گرفت.
يافته ها: بررسي توالي هاي
ITS1 تكثير شده جدايه ها نشان دهنده تفاوت 1.2-0 درصدي بين آنها بود. اين تفاوت ها شامل نواحي جهش يافته، حذف و اضافه شده و نيز اندازه متفاوت ناحيه تكثير شده در بين توالي هاي مورد بررسي بود. همچنين مشخص گرديد كه ناحيه ITS1 زنگ قهوه اي گندم از تعدادي نواحي تكرار شونده بازي تشكيل شده است. اين نواحي از نظر تعداد واحدهاي تكرار شونده و همچنين ترتيب بازها در بين جدايه هاي مختلف متفاوت گزارش شدند.
نتيجه گيري: در مطالعه حاضر با وجود تفاوت در طيف بيماريزايي و جغرافيايي جدايه هاي مورد بررسي، توالي هاي مربوط به ناحيه ITS1 داراي تفاوت اندکي با يكديگر بودند. از آنجايي كه هيچ گونه ارتباط منطقي بين تفاوت هاي موجود در ناحيهITS1 جدايه ها و تفاوت ميان پاتوتايپ و فنوتيپ جدايه ها مشاهده نشد، بنابراين توالي يابي اين ناحيه از DNA ريبوزومي نمي تواند به عنوان يك ماركر جهت تشخيص پاتوتايپ هاي قارچ عامل بيماري زنگ قهوه اي گندم مورد استفاده قرار گيرد.

 
کلید واژه: 

 
موضوعات مرتبط: 
 
ارجاعات: 
  • ندارد
 
 
مقالات نشریه ای مرتبط: 
 
مقالات همایشی مرتبط: 
 

  چکیده انگلیسی بازدید یکساله 96
 
 
آخرین های بلاگ
ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی