تعيين توالي و بررسي فيلوژنتيک ژن NP در ويروس آنفلوانزاي پرندگان تحت تيپ H9N2 جدا شده در شهر اهواز

بيماري آنفلوانزاي پرندگان ناشي از ويروس هاي H9N2 يکي از بيماري هاي مهم طيور صنعتي در ايران و بسياري از مناطق ديگر آسيا مي باشد. جهت آگاهي از خصوصيات ژنتيکي و ارتباط فيلوژنتيکي ويروس هاي H9N2 در شهر اهواز، توالي نوکلئوتيدي ژن نوکلئوپروتئين (NP) در جدايه اي از ويروس آنفلوانزاي پرندگان (A/Chicken/Iran/Ahwaz-1.06)، جدا شده از يک واحد پرورش مرغ گوشتي در حومه اين شهر تعيين و مورد بررسي قرار گرفت. بدين منظور، ناحيه کد کننده ژن NP با آزمايش RT-PCR تکثير و پس از کلونينگ در پلاسميد pMal-C2 تعيين توالي گرديد. توالي نوکلئوتيدي ژن NP در جدايه مورد مطالعه در مقايسه با 24 توالي ديگر اين ژن که از بانک ژن استخراج شدند، مورد بررسي و مطالعه فيلوژنتيکي قرار گرفت. بر اساس توالي ژن NP، جدايه اهواز بيشترين شباهت (94.3 درصد) را با ويروس شاخص زير گروه ژنتيکي G1 نشان داد و همراه با جدايه هاي اخير کشور پاکستان در شاخه اي از اين زيرگروه قرار گرفت. در مقابل، شباهت جدايه A/Chicken/Iran/Ahwaz-1.06 با جدايه سال 1999 ايران (A/Chicken/Iran/11T/99)،86.4  درصد بود و اين دو ويروس در دو زير گروه ژنتيکي مجزا جاي گرفتند. با توجه به مطالعه حاضر مي توان نتيجه گيري نمود که ويروس هاي H9N2 از زمان ورود به ايران دچار تحول ژنتيکي شده اند، يا شايد تاکنون زيرگروه هاي مختلفي از اين ويروس به ايران وارد شده اند.