برای اطلاع از آخرین مقالات علمی و اخبار کرونا(COVID-19) کلیک کنید

مشخصات مقاله

عنوان نشریه: 
 
اطلاعات شماره: 
 
عنوان مقاله: 

استخراج الگوي پروتئيني از داده طيف جرمي ليزري جهت تشخيص سرطان پستان با استفاده از الگوريتم داده كاوي

 
نویسندگان: 
 
آدرس:  
* گروه مهندسی پزشکی، بخش برق، دانشکده فنی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
 
چکیده: 
زمينه و هدف: يكي از مشكلات اساسي در درمان بيماري سرطان، عدم وجود روشي مناسب در تشخيص زودرس آن مي‏باشد. سرطان پستان يكي از بيماري هاي شايع در بين زنان مي باشد كه تشخيص در مراحل اوليه مي تواند تاثير بسزايي در ميزان مرگ و مير زنان داشته باشد. در حال حاضر، نشانگرهاي تومور مناسب براي تشخيص زودرس اين بيماري وجود ندارد. واكنش هاي شيميايي درون يك عضو زنده مي‏تواند بصورت الگوهايي پروتئيني در مايعاتي نظير خون، خلط و ادرار انعكاس داده شود. طيف سنج  جرمي جذب - يونيزاسيون ليزري سطحي ارتقا يافته زمان پروازي يك ابزار مناسب جهت تهيه پروفايل هاي پروتئيني از نمونه هاي بيولوژيك مي باشد. ارايه يك روش داده كاوي جهت انتخاب نشانگرهاي حياتي تفكيك كننده گروه هاي سالم از سرطاني، جز چالش هاي مهم در تحليل الگوهاي پروتئيني محسوب مي شود.روش بررسي: در اين تحقيق، داده هاي پروفايل پروتئيني خونابه بيماران مبتلا به سرطان پستان مورد تحليل قرارگرفت. با ارايه يك مدل رياضي و استفاده از تبديل موجك گسسته، اغتشاشات خط زمينه و نويز الكتريكي در مرحله پيش پردازش حذف گرديد و سپس، تمام سيگنال هاي طيف  جرمي نرماليزه شدند. در اين مقاله، يك الگوريتم داده كاوي تركيبي مبتني بر سه معيار آزمون آماري، اندازه تفكيك پذيري كلاس و امتيازدهي نقاط، معرفي شده است. با روش پيشنهاد شده، بهترين زير مجموعه پروتئين ها از بين 13488 نقطه موجود با حفظ ارزش اطلاعاتي و قدرت تفكيك پذيري انتخاب شد و براي تعيين نشانگرهاي  حياتي استفاده گرديد. با استفاده از روش ارزيابي متقابل K چرخشي، نمونه هاي موجود در مجموعه داده به دو دسته يادگيري و آزمون، بطور تصادفي تقسيم شدند. حداقل آستانه براي آمارگان T مقدار 1.96 انتخاب شد. الگوريتم داده كاوي به نقاط باقيمانده از مرحله آستانه دهي اعمال شد و بهترين زير مجموعه ويژگي ها شامل نشانگرهاي حياتي با قدرت تمايز بالا انتخاب گرديد.يافته ها: با استفاده از روش تحليل تمايز خطي، تعداد 19 پروتئين بعنوان نشانگر حياتي برگزيده شد كه توانست نمونه هاي سالم و سرطاني را با دقت تشخيص 100%، حساسيت 100% و قطعيت 100% از هم تميز دهد.بحث و نتيجه گيري: با توليد اطلاعات كامل از نمونه هاي بيولوژيك مي توان از آنها در تشخيص بيماري هاي با عوامل تشخيصي ضعيف نظير سرطان استفاده نمود. تشخيص بيماري نمونه اي از تفكيك الگو مي باشد. در اين مقاله، يك الگوريتم داده كاوي جهت انتخاب بهترين زير مجموعه از پروتئين ها معرفي گرديد. روش پيشنهادي نشان داد كه با كاهش تعداد نشانگرهاي حياتي منتخب، كه از مزيت هاي اين روش مي باشد، قدرت تفكيك پذيري از سطح مناسبي برخوردار است. نتايج بدست آمده تاكيد دارد كه انتخاب مناسب زير مجموعه پروتئين هاي شاخص تاثير بسزايي در تعيين نشانگرهاي حياتي جهت تشخيص صحيح بيماري دارد.
 
کلید واژه: 

 
موضوعات مرتبط: 
 
 
مقالات نشریه ای مرتبط:  
 
مقالات همایشی مرتبط: 
 
ارتباط خیلی زیاد ارتباط زیاد مرتبط ارتباط کمتر
 
ارجاعات: 
  • ثبت نشده است
 
استنادات: 
  • ثبت نشده است
 
+جهت ارجاع به این مقاله کلیک کنید(Cite).
APA : کپی

منتظری کردی، ح.، و میران بیگی، م.، و مرادی، م.، و نجفی، م. (1387). استخراج الگوی پروتئینی از داده طیف جرمی لیزری جهت تشخیص سرطان پستان با استفاده از الگوریتم داده کاوی. لیزر در پزشکی, 5(2 (پی در پی 28)), 16-25. https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=84758



Vancouver : کپی

منتظری کردی حسین، میران بیگی محمدحسین، مرادی محمدحسن، نجفی معصومه. استخراج الگوی پروتئینی از داده طیف جرمی لیزری جهت تشخیص سرطان پستان با استفاده از الگوریتم داده کاوی. لیزر در پزشکی. 1387 [cited 2022January17];5(2 (پی در پی 28)):16-25. Available from: https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=84758



IEEE : کپی

منتظری کردی، ح.، میران بیگی، م.، مرادی، م.، نجفی، م.، 1387. استخراج الگوی پروتئینی از داده طیف جرمی لیزری جهت تشخیص سرطان پستان با استفاده از الگوریتم داده کاوی. لیزر در پزشکی, [online] 5(2 (پی در پی 28)), pp.16-25. Available: https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=84758.



 

 
چکیده انگلیسی بازدید یکساله 196 مباني نظري و تجربي ونداليسم: مروري بر يافته هاي يك تحقيق
 
آخرین های بلاگ
ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی