تجزيه و تحليل فيلوژنتيکي گونه هاي نوکارديا با استفاده از ژن هاي 16S rRNA ،hsp65 و gyrB

كيخا مسعود

مشخصات مقاله

عنوان نشریه:

انفورماتيك سلامت و زيست پزشكي

اطلاعات شماره:

1396 , دوره 4 , شماره 4 ; از صفحه 305 تا صفحه 312 .

عنوان مقاله:

تجزيه و تحليل فيلوژنتيکي گونه هاي نوکارديا با استفاده از ژن هاي 16S rRNA ،hsp65 و gyrB

نویسندگان:

كيخا مسعود*

آدرس:

* دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

چکیده:

مقدمه: نوکارديا يکي از مهم ترين گروه از اکتينومايست هاي هوازي است که در خاک زندگي مي کند و قادر است به وسيله تنفس و تلقيح تروماتيک به بدن انسان وارد شود و عفونت نوکارديوزيس را به وجود آورد. روش هاي مولکولي يکي از بهترين روش هاي سريع و دقيق براي شناسايي و افتراق اين گروه از باکتري ها مي باشد. هدف از اين مطالعه ارزيابي سه ژن خانه دار در تشخيص و تفريق مهم ترين گونه هاي نوکارديا بود.روش: در اين مطالعه مقطعي، ابتدا توالي ژن هاي 16S rRNA، gyrB و hsp65 براي ده گونه نوکاريا از بانک ژني دريافت شد. سپس توالي ها به کمک نرم افزار هاي AL16S و jPhydit هم رديف شدند، سپس اطلاعات به برنامه MEGA منتقل شد و در نهايت درخت فيلوژنتيک بر اساس هر يک از ژن هاي 16S rRNS، gyrb و hsp65 به طور جداگانه رسم شد.نتايج: تجزيه و تحليل درخت فيلوژنتيک حاصل از ژن هاي 16S rRNA، gyrB و hsp65 نشان داد که همه اين ژن ها گونه هاي نوکارديا را تشخيص دادند. همچنين ژن gyrB بهترين گزينه براي ترسيم روابط فيلوژنتيک گونه نوکارديا مي باشد.نتيجه گيري: بر اساس پژوهش حاضر، براي شناسايي و افتراق صحيح گونه هاي نوکارديا مي بايست چند ژن خانه دار به طور همزمان مطالعه شود.

کلید واژه:

نوکارديا(Q1)تجزيه و تحليل فيلوژنتيک(Q1)16S rRNA(Q1)

چارک 1 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک اول تازگی است.
یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع خیلی زیاد است.
چارک 2 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک دوم تازگی است.
یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع زیاد است.
چارک 3 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک سوم تازگی است.
یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع کم است.
چارک 4 این موضوع در حوزۀ علمی خود، در چارک چهارم تازگی است.
یعنی استقبال پژوهشگران از این موضوع خیلی کم است.

موضوعات مرتبط:

Metapenaeus Affinis اکتینومایستوما اکتینومایسس پستی و بلندی جزیره خارک دریای عمان لاک پشت نوک عقابی ماهی سوکلا مایستوما یومایستوما

مقالات نشریه ای مرتبط:

مقالات همایشی مرتبط:

ندارد

طرح های مرتبط:

مقالات بین المللی مرتبط:

ارتباط خیلی زیاد ارتباط زیاد مرتبط ارتباط کمتر

ارجاعات:

ثبت نشده است

استنادات:

ثبت نشده است

+جهت ارجاع به این مقاله کلیک کنید(Cite).

APA : کپی

کیخا، م. (1396). تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی گونه های نوکاردیا با استفاده از ژن های 16S rRNA ,hsp65 و gyrB. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی, 4(4 ), 305-312. https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=354634

Vancouver : کپی

کیخا مسعود. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی گونه های نوکاردیا با استفاده از ژن های 16S rRNA ,hsp65 و gyrB. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی. 1396 [cited 2022May29];4(4 ):305-312. Available from: https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=354634

IEEE : کپی

کیخا، م.، 1396. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی گونه های نوکاردیا با استفاده از ژن های 16S rRNA ,hsp65 و gyrB. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی, [online] 4(4 ), pp.305-312. Available: https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=354634.