نسخه جدید سایت SID.ir

مشخصات مقاله

عنوان نشریه: 
 
اطلاعات شماره: 
پاييز 1395 , دوره  3 , شماره  3 ; از صفحه 205 تا صفحه 213 .
 
عنوان مقاله: 

روش نوين خوشه بندي داده هاي بيان ژني

 
نویسندگان: 
 
آدرس:  
* شاهرود، میدان هفت تیر، دانشگاه صنعتی شاهرود، کد پستی 3619995161
 
چکیده: 
مقدمه: يکي از تحولات مهم علم ژنتيک، ظهور فناوري ريزآرايه و توليد داده هاي بيان ژني است که امکان مطالعه رفتار هزاران ژن را به طور همزمان فراهم مي کند. خوشه بندي يکي از روش هاي داده کاوي است که در تحليل داده هاي بيان ژني مورد استفاده قرار مي گيرد. از آنجا که عملکرد روش هاي خوشه بندي به شدت تحت تاثير داده ها است، نتيجه خوشه بندي همواره با عدم قطعيت روبه رو بوده و الگوريتمي وجود ندارد که بتوان آن را براي تمام داده ها، کارا قلمداد نمود. در اين تحقيق، در تحليل داده هاي بيان ژني از خوشه بندي اجماعي (ترکيب نتايج چندين الگوريتم خوشه بندي) به جاي اجراي يک الگوريتم منفرد استفاده شده است.روش: اين مقاله عملکرد خوشه بندي اجماعي را بر روي سه مجموعه داده بيان ژني Nutt-v3، Alizadeh-v2 و SU، توسط شاخص رند تعديل يافته مورد ارزيابي قرار مي دهد. براي پياده سازي خوشه بندي اجماعي، دوازده خوشه بندي متفاوت حاصل از ترکيب چهار الگوريتم خوشه بندي با سه معيار عدم تشابه، به طور همزمان روي داده ها اجرا شده اند. پس از ادغام نتايج، ميزان تطابق خوشه هاي تخميني با گروه هاي واقعي توسط شاخص رند تعديل يافته سنجيده شده است.نتايج: مقدار شاخص رند تعديل يافته براي سه مجموعه داده Nutt-v3، Alizadeh-v2 و SU، به ترتيب برابر 1، 0.9 و 0.58 به دست آمد که حاکي از دقت بالاي روش پيشنهادي در کشف ساختارهاي نهفته در داده ها است. همچنين الگوريتم طراحي شده، توانست تعداد واقعي خوشه ها را بدون خطا تشخيص دهد.نتيجه گيري: خوشه بندي اجماعي روشي توانمند براي خوشه بندي داده هاي بيان ژني است. با توجه به دقت اين روش در کشف ساختارهاي واقعي، مي توان آن را با اطمينان جايگزين الگوريتم هاي خوشه بندي منفرد نمود.
 
کلید واژه: 

 
موضوعات مرتبط: 
 
 
مقالات نشریه ای مرتبط:  
 
مقالات همایشی مرتبط: 
  • ندارد
 
طرح های مرتبط: 
 
مقالات بین المللی مرتبط: 
 
ارتباط خیلی زیاد ارتباط زیاد مرتبط ارتباط کمتر
 
ارجاعات: 
  • ثبت نشده است
 
استنادات: 
  • ثبت نشده است
 
+جهت ارجاع به این مقاله کلیک کنید(Cite).
APA : کپی

شاهسونی، د.، و فرهاد، ز. (1395). روش نوین خوشه بندی داده های بیان ژنی. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی, 3(3), 205-213. https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=308136



Vancouver : کپی

شاهسونی داوود، فرهاد زهره. روش نوین خوشه بندی داده های بیان ژنی. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی. 1395 [cited 2022May23];3(3):205-213. Available from: https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=308136



IEEE : کپی

شاهسونی، د.، فرهاد، ز.، 1395. روش نوین خوشه بندی داده های بیان ژنی. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی, [online] 3(3), pp.205-213. Available: https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=308136.



 

 
چکیده انگلیسی بازدید یکساله 331 مباني نظري و تجربي ونداليسم: مروري بر يافته هاي يك تحقيق
 
آخرین های بلاگ
ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی