برای اطلاع از آخرین مقالات علمی و اخبار کرونا(COVID-19) کلیک کنید

مشخصات مقاله

عنوان نشریه: 
 
اطلاعات شماره: 
تابستان 1394 , دوره  4 , شماره  10 ; از صفحه 31 تا صفحه 40 .
 
عنوان مقاله: 

بارکدگذاري DNA برخي از گياهان دارويي

 
نویسندگان: 
 
آدرس:  
* گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه محقق ا ردبیلی، اردبیل
 
چکیده: 

بارگذاري DNA روشي ساده براي شناسايي گونه ها با استفاده از يک توالي کوتاه ژنتيکي از يک بخش استاندارد ژنوم است. اين روش به منظور شناسايي هشت گياه دارويي جمع آوري شده از استان اردبيل مورد استفاده واقع شد. استخراج DNA به روش تغييريافته CTAB انجام گرفت و PCR با آغازگرهاي طراحي شده بر اساس بارکدهاي کلروپلاستي rbcL، trnH-psbA، matK و بارکد هسته اي ITS انجام شد. سپس محصولات PCR خالص سازي و تعيين توالي گرديد. درصد موفقيت تکثير و توالي يابي در نمونه ها به ترتيب 87 و 62، 75 و 37، 62 و 12، 75 و 37 به دست آمد. توالي ها با نمونه هاي موجود در پايگاه داده NCBI همرديف شده و تحت تجزيه بيوانفورماتيکي قرار گرفتند. در درخت خويشاوندي گونه هاي هم جنس بر اساس توالي هاي بارکدهاي rbcL و trnH-psbA از ديگر جنس ها تفکيک شدند. همچنين، در بارکد ITS فقط شيرين بيان با گياهان هم جنس خود قرار گرفت. در اين مطالعه، گياه سوسن چلچراغ براي اولين بار با بارکد rbcL بارکدگذاري شد. SNP بارکدهاي rbcL (کم تر از 30 trnH-psbA (کم تر از 100)، ITS (بيشتر از 200) و matK (کمتر از 20) شمارش شد. بنابراين، بارکد rbcL به دليل قدرت تفکيک بالا، تعداد SNP پايين و جامعيت در اکثر گونه ها، به عنوان بهترين بارکد معرفي شد. با وجود اين، بارکدهاي ITS و trnH-psbA به دليل مشکل مرتبط با توالي يابي مستقيم محصولات PCR و عدم دسترسي به توالي هاي با کيفيت، به عنوان بارکدهاي مکمل شناسايي شدند. بارکد matK به دليل قدرت تکثير و توالي يابي پايين براي نمونه هاي مورد بررسي توصيه نمي شود.

 
کلید واژه: 

 
موضوعات مرتبط: 
-
 
ارجاعات: 
  • ندارد
 
Cite:
APA : کپی

اسدی، ف.، و دژستان، س.، و قهرمان زاده، ر.، و رزمجو، ج.، و آل ابراهیم، م. (1394). بارکدگذاری DNA برخی از گیاهان دارویی. زیست فناوری گیاهان زراعی, 4(10), 31-40. https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=283191



Vancouver : کپی

اسدی فاطمه، دژستان سارا، قهرمان زاده رباب، رزمجو جبرائیل، آل ابراهیم محمدتقی. بارکدگذاری DNA برخی از گیاهان دارویی. زیست فناوری گیاهان زراعی. 1394 [cited 2021April12];4(10):31-40. Available from: https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=283191



IEEE : کپی

اسدی، ف.، دژستان، س.، قهرمان زاده، ر.، رزمجو، ج.، آل ابراهیم، م.، 1394. بارکدگذاری DNA برخی از گیاهان دارویی. زیست فناوری گیاهان زراعی, [online] 4(10), pp.31-40. Available at: <https://www.sid.ir/fa/journal/ViewPaper.aspx?id=283191>.



 
 
مقالات نشریه ای مرتبط: 
 
مقالات همایشی مرتبط: 
 

 
چکیده انگلیسی بازدید یکساله 187 مباني نظري و تجربي ونداليسم: مروري بر يافته هاي يك تحقيق
 
آخرین های بلاگ
ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی