5 SID.ir | تاثير اثرات ترموديناميکي بر تغييرات انرژي و مقايسه برهم کنش هاي ساختاري در پروتئين گيرنده فاکتور رشد عصبي و آنزيم پروتئيني موثر در يادگيري
برای اطلاع از آخرین مقالات علمی و اخبار کرونا(COVID-19) کلیک کنید

مشخصات مقاله

 
عنوان مقاله: 

تاثير اثرات ترموديناميکي بر تغييرات انرژي و مقايسه برهم کنش هاي ساختاري در پروتئين گيرنده فاکتور رشد عصبي و آنزيم پروتئيني موثر در يادگيري

 
نویسندگان: 
 
آدرس:  
* سبزوار، دانشگاه حکیم سبزواری
 
چکیده: 

زمينه و هدف: ديناميک مولکولي، روشي براي شبيه سازي رفتار ترموديناميکي مواد در سه فاز جامد، مايع و گاز با استفاده از نيرو، سرعت و مکان ذرات مي باشد. دربين اين عوامل، مهمترين عامل، نيرو است. در شبيه سازي ديناميک مولکولي کلاسيک، نيرو از پتانسيل کلاسيک به دست مي آيد. پتانسيل کلاسيکي، تابعي از مکان اتم ها يا هسته هاست و به موقعيت الکترون ها در اتم ها وابسته نيست. هدف از اين کار، مطالعه و مقايسه انرژي محاسبه شده براي چند پروتئين مهم بيولوژيکي بوده است.
مواد و روش ها: شبيه سازي ديناميک مولکولي، روشي مناسب براي مدل سازي ميکروسکوپي در مقياس اتمي و مولکولي فراهم مي کند. محاسبات روي يک کامپيوتر شخصي با برنامه هايپر کم انجام شد. ژئومتري بدون هيچ تغييري انجام شد و اين امکان فراهم گرديد که تمام اتم ها، پيوندها و زواياي دي هدرال به طور خود به خود تغييرکند.
يافته ها: انرژي نهايي ساختمان سه پروتئين در شبيه سازي هاي مونت کارلو، ديناميک مولکولي و ديناميک لانگوين انجام شد. بهينه کردن ساختار هندسي و برهم کنش انرژي هاي محاسبه شده با روش هاي مختلف براي چند پروتئين شامل گيرنده فاکتور رشد عصبي و آنزيم پروتئيني موثر در يادگيري مقايسه شد.
نتيجه گيري: در شبيه سازي ديناميک مولکولي کوانتومي، نيرو از پتانسيل کلاسيکي و معادله الکتروني شرودينگر محاسبه مي شود. شبيه سازي کامپيوتري با معرفي روش هاي غيرتعادلي در تعيين خواص انتقالي و درنظرگرفتن اثرات مکانيک کوانتومي توسعه يافته است. انرژي پتانسيل و درجه حرارت درطي شبيه سازي ها، تقريبا ثابت هستند که اين خود، نشان دهنده پايداري ساختمان اين پروتئين ها در دماهاي ذکر شده مي باشد.

 
کلید واژه: 

 
موضوعات مرتبط: 
-
 
ارجاعات: 
  • ندارد
 
 
مقالات نشریه ای مرتبط: 
 
مقالات همایشی مرتبط: 
 

  چکیده انگلیسی بازدید یکساله 170
 
 
آخرین های بلاگ
ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی