برای اطلاع از آخرین مقالات علمی و اخبار کرونا(COVID-19) کلیک کنید

مشخصات مقاله

عنوان نشریه: 
 
اطلاعات شماره: 
 
عنوان مقاله: 

مقايسه ترادف نوکلئوتيدي و اسيد آمينه اي ژن پروتئين پوششي ويروس موزاييک پيسک سبز خيار از استان خراسان با ساير جدايه هاي دنيا

 
نویسندگان: 
 
آدرس:  
* گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، خراسان، ایران
 
چکیده: 

ويروس موزاييک پيسک سبز خيار (CGMMV) گونه هاي زيادي از گياهان کدوييان را در دنيا آلوده مي کند و سبب علائمي از قبيل پيسکي و موزاييک سيستميک روي برگهاي گياهان کدوييان مي شود. در طي يک بررسي، از 198 نمونه کدوييان مشکوک به آلودگي اين ويروس که از مزارع مختلف کدوئيان و گلخانه هاي خيار استانهاي خراسان رضوي و شمالي جمع آوري گرديد، آلودگي 95 نمونه با استفاده از آنتي بادي اختصاصي CGMMV در آزمون DAS-ELISA تاييد شد (ميزان آلودگي 19.7 درصد بود). واکنش RT-PCR با استفاده از يک جفت آغازگر اختصاصي از ناحيه پروتئين پوششي (cp) منجر به تکثير قطعه اي در حدود 486bpشد. محصول PCR پس از همسانه سازي در پلازميد p-drive توالي يابي شد و ترادف بدست آمده پس از هم رديف سازي چندگانه با برخي از توالي هاي موجود در بانک ژن مقايسه گرديد. آناليز فيلوژنتيکي 486 جفت باز از ناحيه ژن پروتئين پوششي اين جدايه (با نام کلات) و ساير جدايه هاي تعيين ترادف شده موجود در بانک ژن نشان داد که همه جدايه هاي ويروس پيسک سبز خيار مي توانند در دو گروه قرار بگيرند: گروه 1 و 2. گروه يک خود به 2 زيرگروه تقسيم شده و جدايه ايراني (کلات) در زيرگروه IA قرار مي گيرد و حداکثر شباهت نوکلئوتيدي را با ساير جدايه هاي اين گروه دارد (بيشترين شباهت نوکلئوتيدي تا 97.9 درصد مي رسد). همچنين درخت فيلوژنتيکي بر اساس توالي اسيدهاي آمينه اي نيز ترسيم شد که بر اساس آن بيشترين شباهت اسيد آمينه اي جدايه 98.1 درصد بود. نتايج اين بررسي اولين گزارش از تعيين ترادف نوکلئوتيدي، تعيين جايگاه تکاملي و مقايسه ترادف نوکلئوتيدي و اسيد آمينه اي جدايه ايراني CGMMV با ساير جدايه هاي دنيا مي باشد.

متن كامل اين مقاله به زبان انگليسي مي باشد لطفا براي مشاهده متن كامل مقاله به بخش انگليسي مراجعه فرماييد.
لطفا براي مشاهده متن كامل اين مقاله اينجا را كليك كنيد

 
کلید واژه: 

 
موضوعات مرتبط: 
 
ارجاعات: 
  • ندارد
 
 
مقالات نشریه ای مرتبط: 
 
مقالات همایشی مرتبط: 
 

  چکیده انگلیسی بازدید یکساله 169
 
 
آخرین های بلاگ
ورود به بلاگ مرکز اطلاعات علمی