در این بررسی 105 نمونه ماهی شاه کولی Chalcalburus chalcoides در اردیبهشت 1383 از مصب رودخانه های هراز، شیرود و گزافرود صید شد. تنوع ژنتیکی و تفاوتهای احتمالی بین جمعیت ها با استفاده از روش RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) و ژن 18S rRNA، مورد بررسی قرار گرفت. استخراج DNA با روش فنل کلروفرم از بافت باله ماهی ها انجام شد. 5 آنزیم از 8 آنزیم برش دهنده (PstI, SacI, SacII, SmaI, BamHI, EcoRI, RsaI, TaqI) پلی مرفیسم را نشان دادند و 10 هاپلوتیپ مختلف مشخص شد. تنوع نوکلئوتیدی بین جمعیت ها از 0.044568 و 0.049442 متغیر بوده و میانگین تنوع در سه جمعیت مورد مطالعه 0.04598±0.0000338 بوده است. تست ناهمگنی با استفاده از شبیه سازی مونت- کارلو با 1000 بار تکرار نشان داده که اختلاف معنی داری بین هاپلوتیپ های سه جمعیت وجود نداشته و جمعیت ها از یک جامعه همگنی می باشد P≥0.05) و (χ2=12.12.