نمونه گيري از تيرماه 1378 لغايت خرداد ماه 1379 در پنج ايستگاه و بصورت ماهانه از هور شادگان انجام گرفت.pH دماي آب و هدايت الكتريكي (EC) در محل اندازه گيري شدند. بيشترين مقادير درجه حرارت در تيرماه و مرداد ماه و اكسيژن در آبان ماه و بهمن ماه مشاهده شده است. مقادير pH در دامنه 2/7 تا 36/9 قرار داشته و در اكثر موارد در دامنه قابل قبولي براي آبزيان مي باشند. نتايج مربوط به سختي و شوري نشان مي دهد كه آب هور شادگان جز آبهاي بسيار سخت و نيز لب شور مي باشد. ميزان اكسيژن محلول در اكثر موارد بالاي 5ppm بوده كه براي رشد و توليد مثل ماهي در حد مطلوب مي باشند. تغييرات Biological Oxygen Demand (BOD5) در دامنه 3 تا 10 ميليگرم در ليتر بوده كه در آبهاي متوسط تا كثيف دسته بندي مي‌شود. مقادير Chemical Oxygen Demand (COD) هور در پاييز افزايش نشان ميدهد. همچنين آب هور از نظر ميزان نيتروژن نيتراتي (N/NO3) و نيتروژن نيتريتي (N/NO2) در حد آبهاي غير آلوده مي باشد. بر اساس نتايج آناليز واريانس عمدتا ايستگاههاي منصوره و عطيش داراي كيفيت آبي مشابه يكديگر مي باشند. همچنين مطالعات انجام شده در سالهاي مختلف نشان مي دهد كه كيفيت آب هور شادگان افت داشته است كه اين مساله احتمالا بدليل كاهش بارندگي و نيز افزايش بار آلودگي در هر شادگان مي باشد.